Imagen: Gerhard Schuster, Wikimedia Commons.
Células, genes y moléculas

Destructor de madera secuenciado

Se ha secuenciado el genoma del hongo degradador de madera Schizophyllum commune, lo que ofrece información sobre la biología de los hongos y sus posibles aplicaciones industriales.

https://www.botany.one/wood-destroyer-sequenced/

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Imagen: Gerhard Schuster, Wikimedia Commons.
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En una oración de apertura bellamente discreta, digna del famoso artículo seminal de 1953 de Watson y Crick que describe la estructura del ADN, Robin Ohmi <em>et al.</em> (Nature Biotechnology, doi:10.1038/nbt.1643) nos recuerdan que 'queda mucho por aprender sobre la biología de los hongos formadores de hongos, que son una importante fuente de alimento, metabolitos secundarios y enzimas industriales'.

Como patógenos y micorrizas, estos organismos también son a veces el azote y el compañero salvavidas, respectivamente, de las plantas. Buenas noticias, entonces, que el genoma de un lignovoro ya ha sido secuenciado.

Hay muchas esperanzas de que el análisis de los 13,210 genes de Comuna SchizophyllumEl genoma de 38.5 megabases de 's conducirá a una mejor comprensión de la biología de la seta venenosa utilizando este "modelo manejable genéticamente para estudiar el desarrollo de hongos". Además, y haciendo de la actividad devoradora de madera del hongo una virtud, desentrañar esta capacidad podría ayudarnos a desarrollar procesos de degradación de madera más eficientes con aplicaciones industriales concomitantes.

Continuamos con el tema del ADN con noticias de dos secuencias genómicas más relevantes para las plantas, el trigo y la manzana. Un equipo del Reino Unido ha elaborado recientemente un borrador del genoma del trigo harinero (Triticum aestivum) variedad 'primavera china', que ha sido puesto a disposición gratuitamente en http://www.cerealsdb.uk.net/.

Aunque se reconoce que es solo un primer paso hacia un genoma completamente anotado, el trigo es uno de los principales cultivos alimentarios básicos del mundo y este hito se considera una contribución significativa a los esfuerzos para apoyar la seguridad alimentaria mundial. Y el resultado no es una hazaña, ya que el genoma del trigo hexaploide es cinco veces más grande que el genoma humano y el cereal tiene una historia evolutiva muy enredada que implica una gran incorporación de material genético de pastos ancestrales.

Mientras tanto, al otro lado del Atlántico (pero publicado en una revista con sede en el Reino Unido), otro grupo ha producido "un borrador de secuencia del genoma de alta calidad de la manzana domesticada".Malus × Español) '(Nature Genetics, doi:10.1038/ng.654). La tarea de secuenciar el genoma del cultivar 'Golden Delicious', que en aprox. 750 megabases y contiene un estimado de 57,386 genes es más grande incluso que el trigo – tomó Riccardo Velasco y más de 80 colaboradores nombrados durante 2 años.

Aunque las manzanas no son un alimento básico en el mismo establo que el trigo, como miembro leñoso de las rosáceas, que incluye muchos cultivos frutales importantes, desentrañar sus secretos genéticos será extremadamente útil para una mayor explotación de esos cultivos, y constituye una adición significativa a la creciente lista de secuencias del genoma vegetal.

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Escrito por

Nigel Chaffey

Soy botánico y ex profesor titular de botánica en la Universidad de Bath Spa (Bath, cerca de Bristol, Reino Unido). Como editor de noticias de la Annals of Botany Contribuí con la columna mensual Plant Cuttings a eso en

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