haba (Vicia faba), a menudo llamado haba, es uno de los cultivos de leguminosas para alimentación y forraje más importantes del mundo. Las habas contienen niveles muy altos de proteína y fibra dietética. Desde el punto de vista agronómico, son más sostenibles que los cultivos de cereales por su capacidad de fijar nitrógeno atmosférico, reduciendo el uso de fertilizantes. Puede crecer bajo riego limitado, salinidad moderada y condiciones de baja temperatura.

Con la demanda de proteínas vegetales y alternativas más saludables a la carne que crecen año tras año, existe la necesidad de centrarse en la obtención de nuevas variedades de habas de mayor rendimiento y más resistentes. Sin embargo, el uso de la selección asistida por marcadores para la mejora de las habas está actualmente limitado por la disponibilidad de datos de secuencias de ADN genómico.

Capturas de pantalla de la base de datos de VfODB (A) Página de inicio de VfODB (B) Páginas de marcadores moleculares (C) Página de microARN (D) Páginas de mapas moleculares (E) Páginas de herramientas (F) Página de germoplasma y G) Página de envío. Crédito de la imagen: Mokhtar et al.

En su nuevo artículo publicado en AoBP, Mojtar et al. presentar el Vicia faba Base de datos ómica (VfODB) como un centro integral de acceso abierto de información de germoplasma, etiquetas de secuencia expresada (EST), etiquetas de secuencia expresada-repeticiones de secuencia simple (EST-SSR) y repeticiones de secuencia simple mitocondrial (mtSSR), marcadores de objetivos de microARN y mapas genéticos en haba. La función VfODB integra marcadores de objetivos de microARN 31536 EST, 9071 EST-SSR y 3023 desarrollados en base a V faba Minería RefTrans-V2.

Mojtar et al. espero que VfODB servirá como una poderosa base de datos para la comunidad de investigación de habas y los criadores interesados ​​en el mejoramiento asistido por genómica. El VfLa base de datos ODB se actualizará regularmente con recursos de genómica, transcriptómica y literatura recientemente publicados. Además, el diseño y las herramientas del concentrador se mejorarán, refinarán y admitirán periódicamente.