Un musgo plumoso.
Ciencia compartida

Ciencia compartida: 26 de septiembre

Esta semana: Hormonas, proteínas y un recordatorio de que la ciencia tiene un componente humano.

https://www.botany.one/science-shared-september-25/

¿Conoces a alguien a quien le gustaría esto?

Aquí están los veinte artículos científicos más compartidos/con más "me gusta"/publicados de nuestra encuesta de esta semana. Una cita de Henri Poincaré me vino a la mente esta semana: "La ciencia se construye con hechos, como una casa se construye con piedras; pero una acumulación de hechos no es más una ciencia que un montón de piedras una casa". El segundo artículo más compartido esta semana es antiguo, de 2009, pero parece que es necesario recordar que la ciencia es más que datos. Como siempre, los artículos de pago están marcados con 💰; de lo contrario, son de acceso gratuito en el momento de la consulta.

Cómo funciona esto

Escaneamos las publicaciones de las personas en el Botánica Automática Enumera y extrae las entradas con enlaces a artículos. Cada vez que se publique una entrada sobre un artículo, este recibirá 4 puntos. Recibirá 3 puntos por una republicación y 1 punto por un "me gusta".

Intentamos añadir a la lista de correo de Botánica a quienes publican sobre botánica (no es necesario que sean enlaces a artículos) aproximadamente el 20 % de las veces o más. Creemos que, dado que la lista en su conjunto comparte un interés por las plantas, este tipo de contenido tiende a destacar.

Si crees que deberías estar en la lista de Botany Auto, pero no lo estás, por favor envía un mensaje a @botany.one en Bluesky.

1. Hormonas peptídicas vegetales: tres décadas de descubrimientos y paradigmas emergentes
Torii, KU · Fisiología de las plantas · 1 publicación · 60 me gusta · 22 republicaciones en Bluesky

En esta revisión, destaco algunas familias selectas de hormonas peptídicas: Sistemina, PSK, INFLORESCENCIA DEFICIENTE EN LA ABSCISIÓN (IDA)/PARA IDE, CLAVATA3/REGIÓN QUE RODEA EL EMBRYO (CLE) y FACTORES DE PATRÓN EPIDERMAL (EPF)/PARA EPF, y analizo cómo los descubrimientos individuales de estos péptidos y sus receptores correspondientes han dado forma a conceptos emergentes en la señalización de péptidos en plantas.

Profesora Keiko Torii @keikoutorii.bsky.social · en Bluesky

Me enorgullece compartir mi revisión de perspectiva sin asistencia de IA "Hormonas peptídicas vegetales: tres décadas de descubrimiento y paradigmas emergentes" para la edición del centenario de
@plantphys.bsky.social 🌱🍅. Es de acceso abierto, ¡así que todos pueden acceder! 1/
academic.oup.com/plphys/advan...

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2. ¿El fin de la teoría en la ciencia?
Pigliucci, M. · Los informes de la EMBO · 1 publicación · 52 me gusta · 16 republicaciones en Bluesky

El filósofo Ludwig Wittgenstein (1889-1951) dijo célebremente que, “de lo que no se puede hablar, hay que callar”. Aunque su consejo se dio en un contexto específico, en realidad es un buen consejo general que Chris Anderson, editor jefe de Con conexión de cable La revista haría bien en prestar atención. El 23 de junio de 2008, Anderson publicó un artículo sobre Wired En su sitio web, titulado "El fin de la teoría: el aluvión de datos vuelve obsoleto el método científico", queda perfectamente claro que no entiende mucho ni de ciencia ni del método científico.

Discutido en Bluesky por @bjenquist.bsky.social.


3. Un método de marcaje por proximidad basado en TurboID para detectar interacciones de proteínas extracelulares en plantas.
Qutb, AM, Szymansky, CM, Hervidores, GJ · bioRxiv · 1 publicación · 15 me gusta · 12 republicaciones en Bluesky

En este estudio, diseñamos y validamos una estrategia de PL basada en TurboID para investigar las interacciones proteicas en el apoplasto de la hoja, utilizando la interacción bien caracterizada entre el elicitor INF1 de Phytophthora infestans y la proteína receptora (RLP) REL en Nicotiana benthamiana. La expresión transitoria de SP-INF1-TurboID (INF1-T) indujo una respuesta de muerte celular (CD) comparable a la desencadenada por INF1 nativo, lo que demuestra que la fusión de la etiqueta TurboID no afectó el reconocimiento de INF1 por REL.

bioRxiv Biología Vegetal @biorxiv-plants.bsky.social · en Bluesky

Un método de marcaje por proximidad basado en TurboID para detectar interacciones de proteínas extracelulares en plantas. https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.22.753433v1

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4. Los análisis filogenómicos nucleares y de plastidios a gran escala informan una clasificación actualizada del Grupo de Filogenia de Angiospermas: APG V
Byng, JW y otros · Revista de Sistemática y Evolución · 2 publicaciones · 15 me gusta · 9 republicaciones en Bluesky

Presentamos aquí una revisión de la clasificación APG que considera los recientes y exhaustivos análisis de cientos de genes nucleares y de plastidios en numerosas especies de angiospermas. Si bien las versiones anteriores de la clasificación APG se basaban principalmente en marcadores de herencia uniparental (ADN de plastidios, generalmente de herencia materna), desde la APG IV ha surgido amplia evidencia de hibridación generalizada y herencia de polimorfismos ancestrales.

Sociedad Botánica de Gran Bretaña e Irlanda (BSBI) @bsbibotany.bsky.social · en Bluesky

Se ha publicado la quinta versión de la clasificación del Grupo de Filogenia de Angiospermas (APG V).
Es de acceso abierto, así que échale un vistazo aquí: onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...

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5. Efectos de los invertebrados y del entorno local sobre las tasas de descomposición de la biomasa vegetal y animal muerta a lo largo de un gradiente de elevación.
Guo, C. y otros · Monografías ecológicas · 1 publicación · 15 me gusta · 9 republicaciones en Bluesky

En este estudio, cuantificamos cómo la altitud, como indicador del macroclima, y ​​las condiciones locales (microclima, vegetación, suelo) interactúan e influyen en las tasas de descomposición y los efectos de los invertebrados en diferentes tipos de necromasa. Realizamos un experimento exhaustivo de descomposición con cinco tipos de necromasa vegetal o animal (carroña, estiércol, hojas, madera de haya y madera de abeto) a lo largo de un gradiente de altitud (entre 600 y 2000 m sobre el nivel del mar) en los Alpes alemanes.

Rupert Seidl @rupertseidl.bsky.social · en Bluesky

¿Existe alguna generalidad en la descomposición entre diferentes sustratos? Lo comprobamos en un experimento a diferentes altitudes, estudiando carroña, estiércol, hojas y madera. Encontramos patrones de descomposición idiosincrásicos, donde las condiciones locales resultaron ser más importantes que el macroclima. @sebseibold.bsky.social doi.org/10.1002/ecm....

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6. Mantenimiento de la variación genética cuantitativa en regiones de recombinación restringida mediante sobredominancia asociativa.
Zhao, Y. y otros · bioRxiv · 1 publicación · 17 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky

Aquí demostramos que los QTL débilmente seleccionados, vinculados a regiones genómicas que presentan AOD, pueden elevar la VA por encima de lo esperado en ausencia de mutaciones incondicionalmente perjudiciales.

Tom Booker @tombooker.bsky.social · en Bluesky

Me entusiasma compartir esta preimpresión. Existe evidencia creciente de que la sobredominancia asociativa conduce al mantenimiento de la heterocigosidad, y nos preguntábamos cómo afectaría esto a la varianza de los rasgos bajo selección estabilizadora:

www.biorxiv.org/content/10.6...

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7. La adopción de cultivos genéticamente modificados favorece los rendimientos y el cultivo en condiciones de cambio climático. 💰
Dong, CY y otros · Naturaleza Cambio Climático · 1 publicación · 16 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky

En este estudio, realizamos un análisis espacial a nivel nacional en Estados Unidos sobre los impactos de la adopción de cultivos genéticamente modificados (GM) durante las últimas cuatro décadas, demostrando que dicha adopción se asocia generalmente con beneficios en el rendimiento. Observamos mayores rendimientos y menor volatilidad en el rendimiento del maíz y la soja, con una atenuación parcial de los efectos adversos del clima sobre el rendimiento, y efectos más moderados en el algodón de secano. Esto implica que el desarrollo de GM y las fuerzas asociadas han mejorado la resiliencia al estrés inducido por el clima.

Evolución de las plantas 🌱🌾 @plantevolution.bsky.social · en Bluesky

Los cultivos transgénicos convencionales ofrecen beneficios inesperados frente al cambio climático: menor volatilidad en el rendimiento, menos pérdidas relacionadas con el clima e incluso una ralentización del desplazamiento hacia el norte de la producción de maíz y soja en Estados Unidos.
#catástrofeclimática
www.nature.com/articles/s41...

Figura 1 | Variación porcentual del uso del suelo destinado a cultivos desde 1978 hasta 2020.Ver en Bluesky →

8. Una historia de dos reinos: procesamiento espacial de la fitocitoquina Zip1 del maíz.
Khan, M. · Fisiología de las plantas · 1 publicación · 13 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky

Las plantas dependen de una comunicación intercelular sofisticada para percibir los cambios ambientales y coordinar las respuestas adecuadas. Entre las moléculas de señalización implicadas en estos procesos se encuentran las fitocitoquinas, un grupo diverso de pequeños péptidos derivados de plantas que regulan el crecimiento, el desarrollo y las respuestas al estrés..

Mauricio König @maukoe.bsky.social · en Bluesky

Estamos muy contentos de ver nuestro trabajo sobre Zip1 destacado en la revista Plant Physiology 🌽

La proteólisis secuencial a través de diferentes compartimentos puede determinar dónde, cuándo y en qué forma actúan las señales peptídicas.

¡Gracias a @mamoonakhan.bsky.social por el interesante comentario!

academic.oup.com/plphys/artic...

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9. Un SNP no codificante en ELF3 edad ELF3β expresión y confiere adaptación de Arabidopsis a un clima continental
Buckley, CR y otros · Fisiología de las plantas · 1 publicación · 13 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky

Los relojes circadianos de las plantas regulan la sincronización de los procesos fisiológicos y de desarrollo que determinan el crecimiento, la reproducción y la fenología estacional. Por consiguiente, la variación natural en los genes del reloj puede influir directamente en la adaptación local, pero aún no se conocen con claridad los componentes del reloj que han sido objeto de selección. Descubrimos que la variación natural en el gen central del reloj EARLY FLOWERING 3 (ELF3) determina la duración del período circadiano y ha sido seleccionada en climas cálidos y estacionales.

Fisiología de las plantas @plantphys.bsky.social · en Bluesky

Un SNP no codificante en ELF3 altera la expresión de ELF3β y confiere adaptación de Arabidopsis a un clima continental (Christopher R Buckley, Anna Philippova, Alexandre Fournier-Level, Michael J Haydon). doi.org/10.1093/plph... #CienciaDeLasPlantas @aspbofficial

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10. Mecanismos genéticos subyacentes a los cambios en el desarrollo floral mediados por la temperatura
Laitinen, RAE, Elomaa, P. · Diario de botánica experimental · 1 publicación · 12 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky

Esta revisión recopila el conocimiento actual sobre los efectos de la temperatura en los rasgos florales y explora los genes y mecanismos subyacentes a los cambios en el desarrollo floral mediados por la temperatura. Destacamos las respuestas específicas de cada rasgo y consideramos las consecuencias adaptativas de la variación de rasgos mediada por la temperatura.

Diario de botánica experimental @jxbotany.bsky.social · en Bluesky

🌸🌡️ RESEÑA DE DARWIN 🌡️🌸

Laitinen y Elomaa revisan el conocimiento actual sobre el impacto de los cambios de temperatura en la regulación genética de los rasgos del desarrollo floral y su plasticidad, así como sus implicaciones para la adaptación y la resiliencia de las plantas.

🔗 doi.org/10.1093/jxb/...

#CienciaDeLasPlantas 🧪

Fig. 3. Ejemplos de diversidad de inflorescencias. (A) Un racimo monopodial básico, como en Arabidopsis thaliana, crece continuamente y genera flores de forma secuencial desde el eje principal (foto: Elli Kotka, Universidad de Helsinki). (B) En el crecimiento simpodial, el eje principal termina en una flor, pero el crecimiento continúa desde un meristemo secundario creando un patrón en zigzag. En las inflorescencias del tomate, las flores, y por consiguiente los frutos, se forman en racimos con forma de zigzag. (C) El grado de ramificación de la inflorescencia en inflorescencias compuestas, como los tirsos en la fresa silvestre (Fragaria vesca), puede variar y determinar en última instancia el número final de flores, afectando el rendimiento de las bayas (foto: Sergei Lembinen, Universidad de Helsinki).Ver en Bluesky →

11. Los biosensores revelan dinámicas redox y de pH citosólico distintas en las plántulas en respuesta a señales de peligro e infección por patógenos.
Más. y otros · Diario de botánica experimental · 1 publicación · 11 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky

Utilizando biosensores genéticamente codificados (GEB), monitorizamos el pH citosólico y la dinámica redox en plántulas completas de Arabidopsis con resolución espaciotemporal. Los tratamientos globales con diversas señales de peligro indujeron primero acidificación y oxidación citosólica en las raíces, seguidas de los pecíolos y, posteriormente, del hipocótilo, revelando una respuesta específica de cada órgano y un gradiente de respuesta bidireccional. Por el contrario, Pseudomonas syringae pv. tomato (Pto) DC3000 indujo una alcalinización citosólica sostenida y suprimió las respuestas redox en los brotes inoculados, incluso cuando se trató conjuntamente con PAMP.

12. El transcriptoma de células individuales revela las vías moleculares de los genes MADS-box en el desarrollo del óvulo de maíz. 💰
li, y. y otros · La célula vegetal · 1 publicación · 8 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky

En este estudio, el análisis transcriptómico de células individuales reveló que ZmMADS8/14 regula la especialización de las células del óvulo y que las estructuras ramificadas están asociadas con una terminación defectuosa del meristemo floral y una mayor proliferación de las células epidérmicas del óvulo en el mutante mads8;14.

13. Condensados ​​biomoleculares en el estrés y el desarrollo de las plantas: avances recientes y conceptos emergentes
Maruri-López, I. y otros · Diario de botánica experimental · 1 publicación · 10 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky

En este trabajo, sintetizamos el conocimiento actual sobre las funciones de los condensados ​​en el desarrollo de las plantas y las respuestas al estrés, centrándonos en Arabidopsis thaliana, donde los conocimientos sobre los mecanismos implicados están más avanzados.

14. La cutícula multicapa que subyace a la coloración estructural en las algas rojas comparte características con la matriz extracelular de los metazoos. 💰
Philippe, G. y otros · Actas de la Academia Nacional de Ciencias · 1 publicación · 9 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky

Aquí, utilizamos enfoques genómicos, transcriptómicos, proteómicos y metabolómicos integrados junto con el perfil analítico de carbohidratos para determinar la composición de la cutícula multicapa en el alga roja. condrus crispus y evaluar su conservación evolutiva.

15. La disminución conjunta del crecimiento y la ramificación fina señala el inicio de la mortalidad del haya europea inducida por la sequía.
Schmied, G. y otros · New Phytologist · 1 publicación · 8 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky

Las sequías severas y recurrentes han causado una disminución generalizada de la cubierta forestal y mortalidad en los bosques europeos. La mortalidad inducida por la sequía ocurre cuando el daño estructural y la disfunción fisiológica perjudican la capacidad de un árbol para recuperarse, pero aún no está claro cuándo los árboles pasan del estrés reversible a la pérdida irreversible de vitalidad a nivel de todo el árbol. Combinamos información detallada sobre la arquitectura de ramificación fina derivada del escaneo láser terrestre con datos de crecimiento radial de 174 árboles para evaluar cómo se relacionan la disminución estructural y del crecimiento con la mortalidad inducida por la sequía en el haya europea ( Fagus sylvatica ).

16. La fosforilación de nitrilasas mediada por CERK1 activa la biosíntesis de auxina y promueve la resistencia a Botrytis cinerea 💰
Zheng, J. y otros · La célula vegetal · 1 publicación · 12 me gusta · 4 republicaciones en Bluesky

En este estudio, identificamos las nitrilasas NIT1, NIT2 y NIT3 como componentes clave de la biosíntesis de auxina durante la infección. Tras la percepción de quitina, CERK1 se asocia con las nitrilasas y las fosforila para estimular la conversión de indol-3-acetonitrilo (IAN) en ácido indol-3-acético (IAA), activando así la señalización de auxina y promoviendo la resistencia a B. cinerea.

17. La evolución estructural de LEAFY revela cambios en la cooperatividad y la dimerización mediados por el ADN durante la transición del agua a la tierra. 💰
Verhage, L. y otros · Planta molecular · 1 publicación · 8 me gusta · 5 republicaciones en Bluesky

Aquí, combinamos la determinación estructural experimental y los ensayos bioquímicos para revelar cómo la dimerización de LFY y las preferencias de unión al ADN cambiaron durante la transición del agua a la tierra. Presentamos estructuras cristalinas del dominio de unión al ADN (DBD) de LFY de la antocerota. Nothoceros aenigmático y el alga Interfilum paradoxumunidos al ADN, demostrando dos mecanismos de dimerización distintos: uno mediado por interacciones directas proteína-proteína y otro impulsado por la cooperatividad mediada por el ADN.

18. El módulo ZmBBM2-BBIP1-RCC1-4 mejora el crecimiento de callos y la eficiencia de la transformación genética en maíz.
Fu, Q. y otros · Fisiología de las plantas · 1 publicación · 7 me gusta · 5 republicaciones en Bluesky

BABY BOOM (BBM) codifica un factor de transcripción AP2 perteneciente a la subfamilia AINTEGUMENTA-LIKE (AIL) y es ampliamente reconocido como un regulador clave de la embriogénesis. En el maíz, la expresión ectópica de ZmBBM mejora notablemente la eficiencia de la transformación genética en múltiples líneas endogámicas. De manera similar, la sobreexpresión de otro homólogo de BBM en maíz, ZmBBM2, promueve la rápida proliferación de callos y aumenta significativamente la eficiencia de la transformación en germoplasma de élite.

19. Funciones no defensivas de los metabolitos especializados de las plantas: fenómenos ecológicos, mecanismos moleculares e implicaciones evolutivas.
Carley, LN · New Phytologist · 1 publicación · 7 me gusta · 5 republicaciones en Bluesky

Los marcos teóricos para el estudio de la química vegetal suelen asumir que la evolución de los compuestos químicos de defensa está determinada principalmente por los herbívoros. Sin embargo, cada vez hay más evidencia de que la variación en estos compuestos también influye en diversas funciones e interacciones no relacionadas con la defensa. Estos efectos correlacionados son generalizados y pueden surgir de una diversidad de mecanismos moleculares subyacentes, que van desde la pleiotropía hasta la regulación compartida y la selección natural pasada correlacionada.

20. Hazlo realidad: Secuenciación de plásmidos rápida y asequible en plataformas ONT con PICARD-seq.
Wolters, R. y otros · bioRxiv · 1 publicación · 12 me gusta · 3 republicaciones en Bluesky

La construcción de plásmidos es fundamental para la biología molecular y la biología sintética; sin embargo, la validación suele limitarse al fragmento insertado en lugar del plásmido completo, y alrededor de un tercio de los plásmidos de laboratorio presentan errores de secuencia que pueden afectar su función. La secuenciación de Sanger no es escalable a plásmidos completos, mientras que los métodos de lectura corta no pueden resolver las partes repetidas de ADN, como los promotores, que son comunes en las construcciones sintéticas. Presentamos PICARD-seq, un protocolo rápido basado en nanoporos que utiliza reactivos de codificación de barras Tn5 disponibles comercialmente y un MinION para secuenciar grupos de plásmidos completos en menos de un día, y evaluamos sistemáticamente las herramientas computacionales disponibles para analizar los datos resultantes.

Imagen de portada: Paraleucobryum enerve by Stefan Gey / iNaturalist CC BY-NC

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Escrito por

Alun Salt

Alun (él) es el productor de Botany One. Su trabajo es mantener el servidor en funcionamiento.

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