Imágenes prediseñadas de virus sobre un fondo botánico.
Ciencia compartida

Ciencia compartida: 3 de octubre

Esta semana: Virus, características florales y Arabidopsis thaliana.

https://www.botany.one/science-shared-october-3/

¿Conoces a alguien a quien le gustaría esto?

Esta semana, una buena parte de la selección proviene de bioRxiv, por lo que el acceso es gratuito. Aún no han sido revisados ​​por pares, pero suelo asumir que si mucha gente comparte una preimpresión, es porque contiene algo interesante. Como siempre, los artículos de pago están marcados con 💰; de lo contrario, el acceso es gratuito en el momento de la consulta.

Cómo funciona esto

Escaneamos las publicaciones de las personas en el Botánica Automática Enumera y extrae las entradas con enlaces a artículos. Cada vez que se publique una entrada sobre un artículo, este recibirá 4 puntos. Recibirá 3 puntos por una republicación y 1 punto por un "me gusta".

Intentamos añadir a la lista de correo de Botánica a quienes publican sobre botánica (no es necesario que sean enlaces a artículos) aproximadamente el 20 % de las veces o más. Creemos que, dado que la lista en su conjunto comparte un interés por las plantas, este tipo de contenido tiende a destacar.

Si crees que deberías estar en la lista de Botany Auto, pero no lo estás, por favor envía un mensaje a @botany.one en Bluesky.

1. NO VEIN es una proteína de inmunidad ancestral involucrada en la interacción planta-virus.
Lågeide, E. y otros · bioRxiv · 2 publicaciones · 83 me gusta · 48 republicaciones en Bluesky

Aquí demostramos que NO VEIN (NOV), una proteína vegetal previamente caracterizada por sus funciones esenciales en el desarrollo de Arabidopsis thaliana, comparte composición de dominios y similitud estructural con Tiamat, una proteína antifágica bacteriana.

Eirik Lågeide @eiriklag.bsky.social · en Bluesky

¡Estoy muy emocionado de compartir con la comunidad el primer preimpreso de mi doctorado! Este es también el primer artículo del grupo de Inmunogenómica Vegetal con @galofir.bsky.social, ¡así que estén atentos para más novedades!
www.biorxiv.org/content/10.6...
1/n 🧵

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2. Evolución gradual de las funciones de desarrollo y simbióticas de DELLA en plantas terrestres
Melkonian, K. y otros · New Phytologist · 2 publicaciones · 44 me gusta · 33 republicaciones en Bluesky

En las plantas con flores, las proteínas DELLA (llamadas así por un motivo de aminoácidos conservado que contiene aspartato (D), glutamato (E), leucina (L), leucina (L) y alanina (A)) son factores de transcripción GIBBERELLIN INSENSITIVE, REPRESSOR OF GA1-3 y SCARECROW (GRAS) y desempeñan múltiples funciones mediadas por la hormona vegetal giberelina (GA).

Catalina Melkonian @katharinamel1.bsky.social · en Bluesky

Nuestro artículo sobre DELLA en Marchantia paleacea ya está publicado (incluyendo algunas actualizaciones):

doi.org/10.1111/nph....

¡Gracias de nuevo a todos los coautores!

#CienciaDeLasPlantas

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3. Divergencia en la tolerancia al marchitamiento en toda la distribución de Mimulus guttatus en ausencia de regulación estomática.
Sucursal, HA y otros · bioRxiv · 4 publicaciones · 56 me gusta · 18 republicaciones en Bluesky

La capacidad de predecir el desempeño bajo estrés, tanto desde el punto de vista de los fenotipos como del entorno, es fundamental para la ecología y la evolución, y puede revelar la vulnerabilidad de las especies al cambio global. Realizamos muestreos de Mimulus guttatus en toda su área de distribución para determinar si los rasgos reproductivos, morfológicos y fisiológicos predicen las respuestas a la sequía. Sorprendentemente, observamos que la respuesta estomática, un mediador clave del equilibrio hídrico, no varió a medida que la sequía se intensificaba.

Jenn Coughlan @jenncoughlan.bsky.social · en Bluesky

Me complace compartir nuestra nueva prepublicación, liderada por el increíble @stressedbranch.bsky.social. Este artículo fue fruto de un esfuerzo titánico por parte de cuatro extraordinarios investigadores postdoctorales de tres laboratorios diferentes y un pequeño ejército de estudiantes de pregrado con un talento excepcional. www.biorxiv.org/content/10.6... 1 / n

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4. La focalización del receptor de superficie celular SRF3 de la cebada por el Blumeria hordei efector AVRA13 se superpone con AVRA13 reconocimiento por MLA e inducción de la muerte celular mediada por NLR.
Shi, W. y otros · bioRxiv · 1 publicación · 26 me gusta · 15 republicaciones en Bluesky

Los patógenos secretan proteínas efectoras para promover la virulencia. A pesar de su reconocimiento por los genes de resistencia Mla de la cebada, los efectores AVR a de Blumeria hordei (Bh), estructuralmente relacionados, se mantienen en el genoma de Bh, lo que sugiere funciones de virulencia críticas para la patogenicidad del hongo. Utilizando el marcaje de proteínas dependiente de la proximidad en cebada transgénica, detectamos interacciones proteicas del huésped distintas para cinco AVR A a pesar de su homología estructural y convergencia en MLA. Informamos sobre la interacción específica del efector AVR A13, altamente conservado, con el receptor de superficie celular SRF3 de la cebada. AVR A13 interrumpe la interacción HvSRF3-HvBAK1 y altera los niveles de HvSRF3 en la membrana plasmática.

Isabel Saur @izzysaurlab.bsky.social · en Bluesky

Es un placer presentar una importante actualización de nuestro manuscrito: www.biorxiv.org/content/10.6...
En colaboración con @grandpahiro.bsky.social,
@sara-stolze.bsky.social, Matthieu Platre y los equipos de Götz Hensel y Gunther Döhlemann lo demostramos... (1/x)

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5. Vinculación de la variación genómica con la adaptación de los rasgos florales a través de los límites de las especies.
Acoca‐Pidolle, S., Wessinger, California, Hileman, LC · New Phytologist · 2 publicaciones · 21 me gusta · 15 republicaciones en Bluesky

En esta revisión, adoptamos una perspectiva de genética cuantitativa y nos preguntamos si la arquitectura genética de la divergencia de rasgos florales depende de la adaptación a sistemas de polinización específicos y cómo influye en la dinámica del ensamblaje de rasgos florales durante la divergencia. Tras revisar los resultados de estudios que mapean rasgos florales divergentes en especies estrechamente relacionadas, destacamos la importancia de combinar enfoques de mapeo de rasgos con enfoques que identifican la variación genómica que diferencia los límites de las especies.

New Phytologist @newphyt.bsky.social · en Bluesky

Vinculación de la variación genómica con la adaptación de los rasgos florales a través de los límites de las especies.

#ReseñaDeTansley por Acoca-Pidolle y otros. @carriewessi.bsky.social

nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...

#cienciavegetal

Ejemplos de divergencias en los rasgos florales entre especies hermanas adaptadas a diferentes modos de polinización. Ver en Bluesky →

6. El oligómero sintético del receptor FLS2 potencia la inmunidad innata de las plantas.
Ma, Z. y otros · Science Advances · 1 publicación · 23 me gusta · 14 republicaciones en Bluesky

El ensamblaje y la oligomerización graduales de los receptores de la superficie celular son cruciales para regular la activación y la renovación del sistema inmunitario. Sin embargo, aún no se comprende cómo el ensamblaje dinámico, regulado espacio-temporalmente, permite una señalización rápida y sostenida en la inmunidad innata de las plantas, debido a la complejidad inherente de sus interacciones dinámicas. Mediante un enfoque de ingeniería sintética, controlamos con precisión los estados de oligomerización del receptor FLS2 de Arabidopsis.

Greg Vert @plantubiquitin.bsky.social · en Bluesky

Un oligómero sintético del receptor FLS2 potencia la inmunidad innata de las plantas | Science Advances www.science.org/doi/10.1126/...

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7. El hongo causante de la piriculariosis del arroz secuestra un péptido RALF del arroz para iniciar la infección.
Fukada, F. y otros · bioRxiv · 1 publicación · 22 me gusta · 13 republicaciones en Bluesky

Los péptidos derivados de plantas regulan la inmunidad y las interacciones huésped-microbio, pero aún se desconoce en gran medida si los patógenos fúngicos aprovechan los péptidos endógenos de las plantas para la selección del sitio de infección. Los factores de alcalinización rápida (RALF) son una familia de hormonas peptídicas vegetales que contribuyen al desarrollo, la reproducción, las respuestas al estrés y la organización de la pared celular de las plantas. Aquí mostramos que OsRALF7, un péptido inmunoactivador del arroz (Oryza sativa), es cooptado por el hongo Magnaporthe oryzae, causante de la piriculariosis del arroz, como una señal derivada del huésped para la formación de apresorios, estructuras de infección especializadas necesarias para la penetración en el huésped. Mientras que el péptido sintético OsRALF7 indujo respuestas de defensa en células de arroz en suspensión, el mismo péptido indujo la formación de apresorios en M. oryzae.

bioRxiv Biología Vegetal @biorxiv-plants.bsky.social · en Bluesky

El hongo causante de la piriculariosis del arroz secuestra un péptido RALF del arroz para iniciar la infección. https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.30.754903v1

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8. Identificación, determinación de fases y anotación estructural de los cromosomas sexuales para ensamblajes genómicos mediante herramientas CBS.
Whitt, L. y otros · bioRxiv · 1 publicación · 20 me gusta · 12 republicaciones en Bluesky

Un genoma de referencia completo para especies con sexos separados determinados cromosómicamente debería contener andamios para todos los homólogos de los cromosomas sexuales. Sin embargo, los cromosomas sexuales presentan desafíos computacionales distintos en comparación con los autosomas. Aquí presentamos un análisis basado en k-meros que utiliza la secuenciación del genoma completo de algunos aislados con sexo identificado: las herramientas de citogenética por secuenciación (CBS). A diferencia de otros enfoques que generalmente abordan un solo aspecto de los cromosomas sexuales, las herramientas CBS buscan guiar a los usuarios desde el descubrimiento del sexo heterogamético hasta la identificación de la región de determinación del sexo (SDR).

Dra. Sarah Carey @scarey.bsky.social · en Bluesky

Me complace compartir nuestra preimpresión de CBS-tools: un análisis basado en k-meros que utiliza la secuenciación del genoma completo de algunos aislados con sexo identificado para guiar a los usuarios desde el descubrimiento del sexo heterogamético hasta la identificación de la región de determinación del sexo.

www.biorxiv.org/content/10.6...

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9. La rotura cromosómica en los neopoliploides de Arabidopsis thaliana ocurre preferentemente en sitios frágiles candidatos que se localizan junto con reordenamientos genómicos antiguos.
Srikant, T. y otros · bioRxiv · 1 publicación · 22 me gusta · 9 republicaciones en Bluesky

Los poliploides recién formados suelen sufrir aneuploidía extensa y reordenamientos cromosómicos. Exploramos si estos son predecibles y se conservan entre genotipos. Cuantificamos la aneuploidía cromosómica completa y segmentaria en matrices de descendencia de Arabidopsis thaliana neopoliploide de dos accesiones (Col-0 y L er). El 29% de la descendencia presentó aneuploidías cromosómicas completas y/o segmentarias. Sorprendentemente, la aneuploidía segmentaria surgió exclusivamente de L er, preferentemente por vía materna, lo que demuestra que el genotipo y el sexo de origen son importantes.

Evolución de las plantas 🌱🌾 @plantevolution.bsky.social · en Bluesky

Nuevo e interesante trabajo de @thanvisrikant.bsky.social y @kbomblies.bsky.social: Los cromosomas en los neopoliploides de #Arabidopsis thaliana se rompen preferentemente en sitios frágiles que corresponden a reordenamientos genómicos antiguos.
#cienciavegetal
www.biorxiv.org/content/10.6...

Detección y análisis de aneuploidías en A. thaliana neotetraploide. (A) Representación esquemática de cómo se generaron los F1 neotetraploides a través del cruce recíproco de líneas endogámicas neotetraploides Col-0 y Ler. Véase la Figura S1A para más detalles. (BD) Ejemplos de detección de aneuploidía utilizando datos de cobertura de secuenciación de tres individuos F1, “Cross_3_Plant_32”, “Cross_3_Plant_25” y “Cross_38_Plant_01”, respectivamente (Figura S2, S3). Los paneles superiores muestran la detección de aneuploidía utilizando un enfoque de cobertura de lectura y los paneles inferiores muestran un enfoque basado en la llamada de variantes. Los cromosomas Ler se indican como L1-L5 (naranja) y los cromosomas Col-0 se indican como C1-C5 (azul). En ambos paneles, cada punto de datos representa un valor medio (cobertura de lectura normalizada / frecuencia alélica) en una ventana de 100 kb del genoma. Para los paneles superiores, los datos de secuenciación se mapean a un genoma híbrido in silico que combina TAIR10.1 (Col-0) y Ler. Para los paneles inferiores, los datos de secuenciación se mapean a un genoma de referencia Ler. (B) Datos de un individuo euploide con cobertura normalizada consistente con dos copias de cada cromosoma heredado de la madre y del padre (panel superior), y frecuencias alélicas que se agrupan alrededor de 0.5 cuando se mapean a un genoma de referencia Ler (panel inferior). (C) Datos de un individuo afectado por una aneuploidía de longitud completa: una pérdida de una copia del cromosoma 2 de Col-0, lo que resulta en una caída en la cobertura (panel superior) y cambios bruscos en la frecuencia alélica (cromosoma inferior) para Chr2. (D) Datos de un individuo afectado por una pérdida segmentaria de parte del cromosoma 4 del progenitor Ler. Ver en Bluesky →

10. La exposición de la planta madre al fuego mejora la germinación de la descendencia.
Gegunde, J., Castellanos, MC, Pausas, JG · Ecología · 1 publicación · 19 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky

Las plantas que rebrotan después de un incendio experimentan condiciones drásticamente alteradas en los ambientes posteriores al incendio. Sin embargo, los efectos de la exposición de las plantas al fuego en los rasgos de la descendencia siguen estando poco estudiados. Muchas especies que rebrotan son plantas herbáceas que florecen y fructifican rápidamente después de un incendio (es decir, floración estimulada por el fuego), desarrollando sus semillas bajo una mayor disponibilidad de recursos e interacciones bióticas modificadas, en particular una polinización mejorada. Planteamos la hipótesis de que estos cambios pueden mejorar el desarrollo temprano de la descendencia a través del aprovisionamiento materno y una mayor calidad de la visita floral y la deposición de polen. Para probar esto, seleccionamos tres geófitas mediterráneas (Asphodelus cerasifer, Drimia maritima, Narcissus assoanus) y comparamos la masa de semillas (3161 semillas) y la germinación total (2262 semillas) entre pares de plantas quemadas y adyacentes no quemadas durante la primera temporada de fructificación posterior al incendio, muestreando seis poblaciones durante 4 años.

Carlos M Herrera @cmhmalani.bsky.social · en Bluesky

No todo es catastrófico después de un incendio. La exposición de la planta madre al fuego favorece posteriormente el tamaño y la germinación de las semillas.
Buen artículo en Ecología @esajournals.bsky.social, por
@gegunde.bsky.social, @calacastellanos.bsky.social y
@jgpausas.bsky.social

doi.org/10.1002/ecy....

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11. Diseño de una herramienta de etiquetado de proximidad basada en TurboID para rastrear los secretomas dinámicos bajo estrés salino. 💰
Lin, D. y otros · New Phytologist · 1 publicación · 19 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky

Las proteínas secretoras son esenciales para el desarrollo de las plantas y la adaptación ambiental; sin embargo, el análisis selectivo de las proteínas transportadas a través de la vía convencional del retículo endoplasmático (RE) al aparato de Golgi sigue siendo un desafío técnico, ya que los secretomas apoplásticos contienen proteínas de múltiples vías de secreción. Desarrollamos un método de marcaje por proximidad TurboID anclado al RE para enriquecer selectivamente las proteínas que ingresan a la vía secretora convencional en Arabidopsis thaliana.

12. Un atlas de semillas de Hypoxis del este de Norteamérica. 💰
Zona, S. y otros · El Diario de la Sociedad Botánica de Torrey · 1 publicación · 27 me gusta · 4 republicaciones en Bluesky

La micromorfología de las semillas de seis especies de Hipoxia Se estudió una especie de Hypoxidaceae del este de Norteamérica (al este de Texas) mediante microscopía electrónica de barrido de bajo vacío con detector de retrodispersión. La forma de las células de la cubierta seminal y la configuración de la cutícula resultaron características de dicha especie.

13. Del pétalo al metal: El lento camino hacia la automatización del etiquetado fenológico a gran escala para especímenes de herbario
Grady, EL y otros · Aplicaciones en Ciencias Vegetales · 1 publicación · 19 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky

Aquí presentamos un sistema de aprendizaje automático que utiliza un enfoque de modelado de conjuntos para detectar flores en especímenes de herbario y proporcionar estos datos a la comunidad de investigación en fenología. Tras probar diversas estrategias para generar datos de entrenamiento, descubrimos que las anotaciones internas elaboradas por expertos eran esenciales para obtener resultados fiables.

14. La abscisión del fruto inmaduro se desencadena por cambios hormonales en la cubierta de la semilla del aguacate.
Haberman, A. y otros · Diario de botánica experimental · 1 publicación · 7 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky

Aquí mostramos que los frutos jóvenes destinados a abscirse sufren una detención del crecimiento antes de encogerse y desprenderse del árbol. El análisis comparativo de RNA-seq indicó que la detención del crecimiento está asociada con una reprogramación del transcriptoma que se inicia en la cubierta de la semilla y luego se transmite al pericarpio y al embrión. Los resultados del perfil de expresión génica y hormonal indicaron que la detención del crecimiento de los frutos jóvenes está asociada con una disminución de la actividad de la auxina y un aumento del ácido abscísico, el precursor del etileno, el ácido 1-aminociclopropano-1-carboxílico y el jasmonato bioactivo jasmonoil-isoleucina en la cubierta de la semilla.

15. La microscopía de alta resolución de células vegetales completas revela cambios inducidos por virus en la conectividad intercelular.
Reagan, Columbia Británica y otros · bioRxiv · 1 publicación · 15 me gusta · 4 republicaciones en Bluesky

Los plasmodesmos (PD) proporcionan a los virus vegetales una vía directa para la propagación célula a célula. La infección viral aumenta el tráfico intercelular a través de los PD, fenómeno denominado "compuerta", pero el mecanismo implicado aún no está claro. En este estudio, mediante una combinación de microscopía electrónica volumétrica de alta resolución e imágenes de células vivas, demostramos que diversos virus aumentaron el número de PD en las hojas infectadas.

16. Las modificaciones diferenciales de ubiquitina de las subunidades VPS37-1 y VPS28-2 de ESCRT-I regulan positivamente la inmunidad vegetal.
Wang, c. y otros · New Phytologist · 2 publicaciones · 9 me gusta · 4 republicaciones en Bluesky

En este estudio, demostramos que XBAT35.2 interactúa in vivo con dos componentes clave del complejo ESCRT-I, VPS37-1 y VPS28-2. XBAT35.2 ubiquitina VPS37-1 con cadenas de poliubiquitina unidas por K48, lo que conduce a su degradación proteasómica, y modifica VPS28-2 con cadenas unidas por K63, reduciendo su interacción con FLS2.

17. Desde la era glacial hasta la actualidad: expansión clonal y variación genética en el rodal de coníferas más antiguo del mundo. 💰
Marthick, JR y otros · American Journal of Botany · 1 publicación · 6 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky

La clonalidad está muy extendida entre las plantas, pero los procesos que rigen la diversidad genética dentro de los clones más antiguos siguen sin estudiarse a fondo. Investigamos esta dinámica utilizando una supuesta masa clonal de 10,500 años de antigüedad de una de las especies de árboles más longevas del mundo, la conífera paleoendémica Lagarostrobos franklinii, en el monte Read, en el oeste de Tasmania.

18. Comprender y diseñar las interacciones receptor-ligando
Doblas, VG y otros · The Plant Journal · 1 publicación · 9 me gusta · 5 republicaciones en Bluesky

En este número especial, una serie de artículos de revisión de actualidad destacan temas nuevos y emergentes en las interacciones receptor-ligando, así como una mayor comprensión de las vías clásicas de los receptores. Al comprender los mecanismos moleculares de la función de los receptores, se hace posible la ingeniería de redes de reconocimiento y señalización.


19. La secuenciación de ARN de núcleo único revela la trayectoria de desarrollo y las redes reguladoras transcripcionales de los tricomas en
Artemisia annua

Lv, Z. y otros · Diario de botánica experimental · 1 publicación · 10 me gusta · 4 republicaciones en Bluesky

La artemisa (Artemisia annua) produce y deposita artemisinina en sus tricomas glandulares, pero los mecanismos moleculares del desarrollo de estos tricomas aún no se comprenden del todo. En este estudio, realizamos una secuenciación de ARN de núcleo único en plántulas de A. annua de 10 días de edad, revelando la expresión específica de ARN en las células de los tricomas foliares.

20. El nitrato reconfigura transitoriamente la transcripción en el xilema en desarrollo. Populus madera para promover la expansión celular a través de CRF4
Choudhary, S. y otros · La célula vegetal · 2 publicaciones · 5 me gusta · 4 republicaciones en Bluesky

El nitrato funciona tanto como nutriente como molécula señalizadora, pero se desconoce cómo se percibe y se traduce en respuestas de desarrollo dentro de los tejidos leñosos. Aquí mostramos que el xilema en desarrollo del álamo híbrido (Populus tremula × P. tremuloides) genera una respuesta transcripcional rápida y específica del tipo celular al nitrato que promueve la expansión de las células del xilema.

Imagen de portada: Clip art.

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Escrito por

Alun Salt

Alun (él) es el productor de Botany One. Su trabajo es mantener el servidor en funcionamiento.

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