Aquí tenéis un resumen de los 20 artículos más populares que habéis compartido esta semana en Bluesky. Los artículos de pago están marcados con 💰; de lo contrario, son de acceso gratuito en el momento de la consulta.
Esta semana el estilo es un poco diferente. Estoy intentando crear un programa que ayude a los editores a formatear el artículo para correo electrónico y web, para que otra persona pueda hacerlo en el futuro. El proceso aún no está del todo terminado.
Cómo funciona esto
Escaneamos las publicaciones de las personas en el Botánica Automática Enumera y extrae las entradas con enlaces a artículos. Cada vez que se publique una entrada sobre un artículo, este recibirá 4 puntos. Recibirá 3 puntos por una republicación y 1 punto por un "me gusta".
Intentamos añadir a la lista de correo de Botánica a quienes publican sobre botánica (no es necesario que sean enlaces a artículos) aproximadamente el 20 % de las veces o más. Creemos que, dado que la lista en su conjunto comparte un interés por las plantas, este tipo de contenido tiende a destacar.
Si crees que deberías estar en la lista de Botany Auto, pero no lo estás, por favor envía un mensaje a @botany.one en Bluesky.
Una receta para un buen π. Cómo estimar correctamente las estadísticas descriptivas de genética de poblaciones y por qué deberíamos informarlas sistemáticamente.
Brault, M. y otros · Genoma Biología y Evolución
Ante el cuestionamiento de la utilidad de generar tal cantidad de datos genómicos, ya sea por razones ecológicas o económicas, sostenemos que la publicación de datos debería estandarizarse para garantizar su reutilización a largo plazo. Basándonos en una revisión bibliográfica y ejemplos clave, destacamos que, a pesar del creciente volumen de datos disponibles, la falta de documentación metodológica y la ausencia de metadatos hacen que la mayoría de los conjuntos de datos de polimorfismos publicados sean incomparables, lo que impide el cálculo de estadísticas significativas y la aplicación de los principios FAIR (Localizables, Accesibles, Interoperables y Reutilizables).
Jeffrey Ross-Ibarra @jrossibarra.bsky.social · en Bluesky
Gente. @ksamuk.bsky.social y otros ya han planteado este argumento antes. Existe buen software para hacerlo correctamente. Aquí está el argumento de nuevo:
¡Los sitios invariantes importan! No están presentes en los archivos VCF estándar, pero muchos programas simulan que sí lo están.
academic.oup.com/gbe/article/...
Antagonistas extracelulares: Ataque y contradefensa en el apoplasto. 💰
Armer, VJ, van der Hoorn, RAL · Revista Anual de Fitopatología
Las interacciones extracelulares son cruciales en la carrera armamentística entre plantas y patógenos. Patógenos fúngicos, bacterianos y oomicetos manipulan el apoplasto para controlar el pH, la absorción de agua, los niveles de azúcar y la disponibilidad de nutrientes. Las plantas responden a la infección con una explosión oxidativa y secretan metabolitos tóxicos e hidrolasas dañinas, pero los patógenos adaptados han desarrollado mecanismos complejos para neutralizar los metabolitos reactivos y tóxicos de las plantas e inhibir o degradar las hidrolasas. Los patógenos también evitan ser reconocidos ocultando, degradando o modificando sus elicitores e inactivando los receptores de la superficie celular de diversas maneras. En esta revisión, resumimos nuestro conocimiento actual sobre los fascinantes mecanismos de ataque y contradefensa en las interacciones extracelulares entre plantas y patógenos.
Enfoque global en la ciencia vegetal @plant-sci.bsky.social · en Bluesky
🌱🧬Los patógenos manipulan el apoplasto controlando el pH, el agua y los nutrientes. Las plantas se defienden con explosiones oxidativas, toxinas e hidrolasas. Los patógenos adaptados desarman estas defensas y se ocultan para evitar ser detectados.
Carrera armamentística molecular fuera de la célula @annualreviews.bsky.social www.annualreviews.org/content/jour...
Reducir la variabilidad en las evaluaciones del estado del hábitat es fundamental para que las métricas del mercado de la naturaleza representen un verdadero cambio en la biodiversidad.
Salamanca León, I. y otros · Ciencia y práctica de la conservación
La necesidad de contar con métricas estandarizadas para medir las pérdidas y ganancias de biodiversidad ha llevado a muchos países e iniciativas del sector privado a adaptar la Métrica de Biodiversidad Obligatoria de Inglaterra para la Ganancia Neta de Biodiversidad (BNG, por sus siglas en inglés). La BNG requiere un incremento mínimo del 10 % en las unidades de biodiversidad derivadas del desarrollo de infraestructuras, y el número de unidades de biodiversidad depende en parte de las evaluaciones de las condiciones del hábitat realizadas sobre el terreno. Realizamos simulaciones para explorar la influencia de la incertidumbre en las evaluaciones de las condiciones y descubrimos que existe una variabilidad inherente que introduce sesgos, incluso cuando la condición real de un hábitat permanece inalterada.
Julia PG Jones @juliajones.bsky.social · en Bluesky
¿Le interesa el Ganancia Neta de Biodiversidad, los créditos de biodiversidad o las métricas de biodiversidad en general?
Si es así, ¡este hilo (nuestro nuevo documento) es para ti!
Analizamos la eficacia del indicador de biodiversidad oficial de Inglaterra para medir el cambio. #BNG
conbio.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...
Biogeografía de las interacciones bióticas: Un marco para comprender cómo las interacciones entre especies dan forma a los patrones de biodiversidad a diferentes escalas.
Galiana, N.Araújo, MB · PLoS Biology
La integración entre biogeografía y ecología se ha visto históricamente limitada por la falta de datos sobre interacciones bióticas a gran escala espacial. La aparición de nuevos métodos y datos de redes ecológicas de alta calidad a escala biogeográfica está allanando el camino hacia una integración más profunda de ambas disciplinas. Este ensayo examina dicha integración a través de tres áreas de investigación interconectadas: los efectos de las interacciones bióticas en la distribución de especies; la influencia de los gradientes ambientales en las interacciones bióticas; y los efectos de las interacciones bióticas en el medio ambiente. Se discuten los avances recientes y los principales desafíos, y se ofrecen sugerencias sobre cómo profundizar en la comprensión de los patrones y procesos de biodiversidad a diferentes escalas.
Discutido en Bluesky por @bjenquist.bsky.social.
Los campos de cultivo complementan la biodiversidad en los pastizales permanentes de los paisajes europeos.
Boetzl, FA y otros · Nature Communications
Utilizando 86 pares de pastizales permanentes y campos de colza en cinco países europeos, evaluamos cómo el tipo de hábitat influyó en las comunidades de plantas, mariposas, abejas silvestres y carábidos, y si el aumento de la cantidad de pastizales en los paisajes circundantes fomenta la transferencia de biodiversidad asociada a los pastizales a los campos de colza. Descubrimos que el tipo de hábitat, más que la cantidad de pastizales a nivel de paisaje, determina la diversidad y moldea las comunidades de especies: las plantas y las mariposas son más diversas en los pastizales, mientras que las abejas silvestres y los carábidos son igual o más diversos en los campos de colza.
Fabian A. Boetzl @fboetzl.bsky.social · en Bluesky
¡Recién salido del horno! 📄Hemos constatado que los campos de cultivo y los pastizales seminaturales sustentan una #biodiversidad complementaria en toda #Europa. Los hábitats seminaturales por sí solos no son suficientes para garantizar la biodiversidad de las tierras agrícolas; es fundamental una gestión de los campos de cultivo que respete la biodiversidad. www.nature.com/articles/s41...
Ver en Bluesky →Mejorar la gestión de los residuos naturales en las playas para la conservación de la biodiversidad. 💰
Gómez-Serrano, M. Á. · Tendencias en ecología y evolución
Los restos naturales depositados por el mar son esenciales para el funcionamiento del ecosistema playero. A medida que aumenta la demanda turística en la costa, los valores estéticos cobran mayor importancia, y la limpieza indiscriminada de residuos se extiende de las playas urbanas a las naturales. Es necesario un cambio en la gestión de los residuos playeros para garantizar que los restos orgánicos cumplan su función allí donde el mar los depositó.
Miguel A Gómez Serrano @gomezserrano-ma.bsky.social · en Bluesky
Los restos mareales son esenciales para la conservación de las aves que crían en las playas: www.cell.com/trends/ecolo...
Los pollos de Chorlitejo patinegro se esconden en ellos cada vez que se acerca a un peligro, lo que incluye paseantes y bañistas. Mantener los restos en su sitio es vita para ellos.
Ver en Bluesky →El análisis integrado de fósiles y estimaciones de tiempo de divergencia molecular sitúa el origen de las angiospermas en el Jurásico tardío.
Wu, R. y otros · Nature Plants
Las escalas de tiempo moleculares se basan en la calibración de la evolución molecular con el tiempo geológico mediante restricciones fósiles, pero las estrategias de calibración convencionales utilizan datos fósiles limitados y, a menudo, interpretados de forma subjetiva. En este trabajo, utilizamos el modelo bayesiano de puente browniano para derivar densidades de calibración basadas en datos extensos de ocurrencia de fósiles. Este enfoque integra la incertidumbre sobre la diversidad actual e histórica para estimar la edad de los clados.
Nature Plants @natplants.nature.com · en Bluesky
Nuevo artículo de acceso abierto: "El análisis integrado de fósiles y el tiempo de divergencia molecular estiman un origen de las angiospermas en el Jurásico tardío". rdcu.be/foNXh
... sugieren un origen de las plantas con flores en el Jurásico tardío, lo que indica una historia temprana y críptica de las angiospermas.
Ver en Bluesky →La calidad del paisaje determina las respuestas ecológicas a la pérdida y fragmentación del hábitat.
Fletcher Jr, RJ y otros · Ecología de la naturaleza y evolución
Diversos estudios sugieren que la calidad de los terrenos que rodean los fragmentos de hábitat puede modificar los efectos de la pérdida y fragmentación del hábitat sobre las especies e influir en las predicciones de biodiversidad en distintas regiones. Dado que las matrices paisajísticas suelen ser complejas y varían con los cambios en el hábitat, aislar dichos efectos resulta un desafío. En este trabajo, analizamos los efectos de la pérdida y fragmentación del hábitat, así como la calidad del paisaje circundante, mediante un experimento manipulativo a gran escala sobre un sistema planta-herbívoro.
Robert Fletcher @fletcherecology.bsky.social · en Bluesky
¡Recién salido! ¡Estoy emocionado de compartirlo!
El terreno que rodea los hábitats restantes tiene efectos desproporcionados para las especies, tan grandes o incluso mayores que la pérdida y la fragmentación del hábitat.
Fue un enorme esfuerzo experimental para aislar la atribución en ecología y conservación del paisaje.
@camzoology.bsky.social @brunalab.bsky.social
El perfil de actividad policromática distingue las proteasas de cisteína y sus isoformas en las plantas.
Zheng, K. y otros.b · bioRxiv
El perfilado basado en la actividad con sondas fluorescentes es una herramienta poderosa para la caracterización funcional de clases completas de enzimas en proteomas brutos. En este estudio, descubrimos que los cócteles de sondas que contienen el grupo reactivo E-64, unido a diferentes fluoróforos mediante enlaces cortos, permiten diferenciar el marcaje de las proteasas de cisteína tipo papaína y sus isoformas debido a su afinidad diferencial por estas sondas. Esto produce un marcaje policromático con colores aparentes específicos para las distintas familias e isoformas de proteasas.
Mariana Schuster @marischuster.bsky.social · en Bluesky
Me entusiasma compartir esta historia sobre cómo los cócteles pueden ayudarte en tu investigación sobre proteínas 🍸.
www.biorxiv.org/content/10.6...
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Anticipe, aclimate, recupérese y recuerde: cómo la integración de señales espaciotemporales controla la resiliencia al estrés por inundaciones en las plantas. 💰
Rodríguez-Cisneros, C. y otros · Diario de botánica experimental
Las inundaciones constituyen un importante estrés abiótico que restringe el crecimiento y la supervivencia de las plantas terrestres. La capacidad de los tejidos vegetales para evitar o soportar la privación crítica de oxígeno (hipoxia) y el consiguiente daño por reoxigenación es vital para su supervivencia. La inmersión desencadena una rápida señalización de etileno e hipoxia que, a su vez, controla las respuestas de aclimatación, promoviendo la resiliencia de la planta. Curiosamente, se ha demostrado que una amplia gama de factores ambientales e internos adicionales influyen en estas vías de señalización canónicas asociadas con la aclimatación y la tolerancia a las inundaciones. En este trabajo, analizamos cómo esta señalización integradora dependiente de etileno e hipoxia permite a las plantas anticipar y prepararse para el posible estrés por hipoxia inducido por las inundaciones, ajustar la aclimatación según el contexto ambiental y metabólico interno, y orquestar eficazmente las respuestas de reoxigenación.
Enfoque global en la ciencia vegetal @plant-sci.bsky.social · en Bluesky
🌿💧 Las inundaciones desencadenan la liberación de etileno y la señalización de hipoxia. Las plantas se anticipan, se aclimatan, se recuperan y recuerdan. La memoria del estrés ayuda a la supervivencia ante futuras inundaciones.
Señalización integradora para la resiliencia. #cienciavegetal
@jxbotany.bsky.social @hartman-plantlab.com academic.oup.com/jxb/advance-...
El receptor inmunitario vegetal LORE se une a ligandos de ácidos grasos 3-hidroxi agonistas y antagonistas a través de un bucle dinámico en su dominio de lectina de tipo G.
Shu, LJ y otros · bioRxiv
Lin Jie Shu @linjieshu.bsky.social · en Bluesky
¡Se ha verificado la primera estructura de unión a ácidos grasos en un "dominio de lectina de tipo G" entre los PRR de plantas!
Se ha publicado un nuevo artículo de LORE del laboratorio Ranf en la TUM en Alemania y la Universidad de Friburgo en Suiza, y de @antonelladipizio.bsky.social en la TUM: doi.org/10.64898/202...
Aquí tenéis algunos aspectos destacados interesantes:
Arrojando luz sobre la proteólisis vegetal: sensores fluorescentes codificados genéticamente como herramientas para perfilar las actividades de las proteasas. 💰
Fernández-Fernández, Á. D. y otros · La célula vegetal
Biología de los sistemas vegetales @psb-vib.bsky.social · en Bluesky
Artículo de @vanbreusegemlab.bsky.social y @moritznowack.bsky.social en @theplantcell.bsky.social
academic.oup.com/plcell/advan...
El modelado a nivel genómico de la unión de factores de transcripción en plantas permite identificar variantes reguladoras asociadas con rasgos fenotípicos.
Peleke, FF y otros. · Nature Communications
Leibniz IPK @leibnizipk.bsky.social · en Bluesky
Un equipo liderado por @leibnizipk.bsky.social y @fz-juelich.de ha desarrollado un modelo de IA que predice dónde se unen las proteínas reguladoras al ADN de las plantas para activar y desactivar genes. El estudio se ha publicado en "Nature Communications".
➡️Papel: tinyurl.com/mryxendn
➡️PR: tinyurl.com/37kpbpzh
Ver en Bluesky →Visualización de la doble fertilización en el maíz
Calhau, Arkansas, Widiez, T. · bioRxiv
Thomas WIDIEZ @thomaswidiez.bsky.social · en Bluesky
¡Nos complace compartir nuestro protocolo para la obtención de imágenes de la doble fertilización en maíz! 🌽🔬
Línea www.biorxiv.org/content/10.6...
Esperamos que este recurso sea útil para los investigadores que estudian la reproducción de las plantas, la fertilización y el desarrollo temprano de las semillas.
Ver en Bluesky →El análisis integrador de la fotosíntesis CAM revela su impacto en el metabolismo primario en Yuca
Wickell, D. y otros · Diario de botánica experimental
Carolina Heyduk @kheyduk.bsky.social · en Bluesky
Artículo de laboratorio que explora la ómica integrada en especies de Yucca C3 y CAM estrechamente relacionadas. Convencí a @wickellomics.bsky.social para que viniera al laboratorio con este conjunto de datos como algo fácil de aprovechar, pero resultó ser todo lo contrario, ja. ¡Gracias a David y a todos los coautores por lograr su publicación! doi.org/10.1093/jxb/... 1/2
Ver en Bluesky →Inducción de haploides in planta en maíz y tomate mediante la interrupción de KOKOPELLI
Jacquier, Nuevo México y otros · bioRxiv
Thomas WIDIEZ @thomaswidiez.bsky.social · en Bluesky
¡La semana de preimpresiones 😅!... Segundo MS ya en BioRxiv
▶️ La edición del genoma de KOKOPELLI confiere capacidad de inducción haploide no en uno, sino en todos.
DOS cultivos: 🌽 maíz y 🍅 tomate
Línea doi.org/10.64898/202...
Muchísimas gracias a todos los involucrados y a nuestros colaboradores: @nathaliegonzalez.bsky.social, @inrae-bfp.bsky.social
Ver en Bluesky →El estrés térmico induce la formación de gametos masculinos no reducidos al afectar la traducción en los meiocitos de Arabidopsis. 💰
Schindfessel, C. y otros · La célula vegetal
La célula vegetal @theplantcell.bsky.social · en Bluesky
El estrés por calor induce la formación de gametos masculinos no reducidos al dirigirse a la traducción en los meiocitos de Arabidopsis (Cédric Schindfessel, Albert Cairo, Pavlína Mikulková, Chunlian Jin, Laura Lamelas, Philip A Wigge, Karel Říha, Danny Geelen) doi.org/10.1093/plce... #CienciaDeLasPlantas @aspbofficial
Ver en Bluesky →Los plastoglóbulos compartimentan la asimilación de nitrógeno en el maíz - Nature
Chen, D. y otros · Nature
Ben Field 🌿 @benfield1.bsky.social · en Bluesky
Los plastoglóbulos cloroplásticos compartimentan la asimilación de nitrógeno en el maíz #cienciavegetal www.nature.com/articles/s41...
Ver en Bluesky →Digitalización de colecciones para aprovechar todo el potencial de la palinología: Un estudio de caso con la colección de palinología del Smithsonian.
Jaramillo, C. y otros · PLANTAS, PERSONAS, PLANETA
Plantas, Gente, Planeta @plantspeopleplanet.bsky.social · en Bluesky
Digitalización de colecciones para aprovechar todo el potencial de la palinología: Un estudio de caso con la colección de palinología del Smithsonian.
Artículo sobre métodos y técnicas de Carlos Jaramillo y otros.
nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/...
#ÚltimoNúmero #CienciaDeLasPlantas
Ver en Bluesky →Cuando la morfología se detiene: evolución floral restringida en un género de leguminosas megadiverso.
Maianne, M. y otros · Annals of Botany
Annals of Botany @annbot.bsky.social · en Bluesky
🎉 ¡Buenas noticias! El artículo «Cuando la morfología se detiene: evolución floral restringida en un género de leguminosas megadiverso» en @annbot.bsky.social, de M. Maianne @mimomaianne.bsky.social, ahora es #gratis durante 2 semanas 🧵1/10
👉 doi.org/rbsb
@souzayagob.bsky.social
@fmachado.bsky.social
@aquitemcaqui.bsky.social
Ver en Bluesky →Imagen de portada: Madera a la deriva por @abigalejachyms-team / Canva
