Aquí está el resumen de esta semana. Encontrar una imagen que acompañe a los artículos puede ser difícil a veces. Por ejemplo, quería buscar pastizales, pero muchas fotos de pastizales se centran en el depredador escondido en la hierba. Sin embargo, una búsqueda de Andropogón Esta foto muestra una silueta recortada por una aurora boreal. Como es habitual, los artículos de pago están marcados con 💰; de lo contrario, son de acceso gratuito en el momento de la consulta.
Cómo funciona esto
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1. La destrucción de los pastizales provoca cambios en los rasgos de las plantas que persisten durante la recuperación. 💰
Nerlekar, AN y otros · Actas de la Academia Nacional de Ciencias · 2 publicaciones · 53 me gusta · 27 republicaciones en Bluesky
Sintetizamos datos de características de 742 especies de plantas provenientes de 24 estudios realizados en seis continentes para comprender cómo se comparan las características de las especies vegetales representativas de pastizales primarios y secundarios. En comparación con los pastizales primarios, las plantas representativas de pastizales secundarios eran más altas y presentaban hojas con mayor contenido de nitrógeno, mayor área foliar específica y menor contenido de materia seca.
Lars Brudvig @lars-brudvig.bsky.social · en Bluesky
Novedad de @ashishnerlekar.bsky.social @llseedsull.bsky.social mía y de muchos otros: La destrucción de los pastizales provoca cambios en los rasgos de las plantas que persisten durante la recuperación.
www.pnas.org/doi/10.1073/...
eeb.msu.edu/news/why-anc...
2. La señalización TOR–NOT4 acopla la traducción al control de calidad cotraduccional en plantas.
Schwarze, MA y otros · Nature Communications · 1 publicación · 42 me gusta · 21 republicaciones en Bluesky
La síntesis de proteínas debe estar estrechamente coordinada con el control de calidad para prevenir el estrés proteotóxico; sin embargo, los mecanismos subyacentes a la vigilancia cotraduccional en plantas, y cómo se alinean con el resultado de la traducción, aún no se comprenden del todo. En este estudio, identificamos tres ubiquitina ligasas E3 similares a NOT4 en Arabidopsis thaliana como reguladoras del control de calidad cotraduccional de proteínas y descubrimos una conexión funcional entre NOT4 y la vía de señalización TOR (target of rapamicina) que coordina la capacidad de control de calidad con el resultado de la traducción.
Dan Gibbs 🌱🧬 @djgibbs.bsky.social · en Bluesky
La síntesis de proteínas responde dinámicamente al entorno, pero ¿cómo se aseguran las células de que sus mecanismos de control de calidad de las proteínas estén adecuadamente adaptados a la cambiante demanda de traducción?
Abordamos esta cuestión en nuestro nuevo estudio publicado en @natcomms.nature.com. www.nature.com/articles/s41...
3. Plantas herbáceas en ecosistemas forestales: cien preguntas fundamentales y aplicadas
Radhamoni, HVN y otros · Revista de ciencia de la vegetación · 1 publicación · 22 me gusta · 13 republicaciones en Bluesky
Conscientes de esta laguna de conocimiento y de la importancia crucial de ampliar y optimizar el alcance de la investigación sobre hierbas forestales, nos propusimos identificar 100 preguntas fundamentales y aplicadas relacionadas con la ecología de este singular grupo de plantas. En primer lugar, realizamos una encuesta ampliamente difundida en línea entre la comunidad ecológica, que generó un total de 130 preguntas. Posteriormente, organizamos un taller de tres días con investigadores de hierbas invitados, expertos en diversos ecosistemas forestales, durante el cual las preguntas se fueron concretando mediante múltiples rondas de debate, revisión y reformulación.
Martín Dovciak🌳🌱🌻 @dovciak-lab.bsky.social · en Bluesky
🌿 ¡Nuevo estudio! La capa herbácea del bosque puede representar hasta el 80% de la diversidad vegetal, pero aún así ha sido poco estudiada.
Me complace haber contribuido a esta colaboración liderada por Yale, que identificó 100 preguntas para avanzar en la ecología del estrato herbáceo forestal.
¿Qué nos perdimos?
🔗 onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10....
4. Predicción de la complejidad de los organismos vegetales basada en la anotación de factores de transcripción: un enfoque de IA
Varshney, D. y otros · bioRxiv · 1 publicación · 16 me gusta · 11 republicaciones en Bluesky
La forma en que evoluciona la complejidad morfológica sigue siendo un enigma. Si bien existen evidencias en algas, plantas y animales de que la diversificación del repertorio de factores de transcripción (FT) es la causa de la evolución de la complejidad de los organismos, existen muchos ejemplos de linajes que siguen su propio camino de evolución de la complejidad, por ejemplo, mediante la expansión de familias particulares... Aquí, ampliamos un conjunto de datos previamente disponible sobre el número de tipos celulares de 12 a 82 proteomas e introducimos un esquema de plan corporal de cuatro clases.
Stefan A. Rensing @rensingstefan.bsky.social · en Bluesky
¿Puede la arquitectura TabPFN, basada en transformadores y preentrenada, predecir la complejidad de los organismos vegetales en función de su conjunto de factores de transcripción? Sí, puede: www.biorxiv.org/content/10.6...
¡Me alegra escuchar tu opinión!
@dvarshney.bsky.social @jandevries.bsky.social @watertoland.bsky.social
5. Más rápidos, más grandes, más severos: la propagación extrema de incendios forestales sienta las bases para el cambio de los ecosistemas forestales en el oeste y el norte de Norteamérica.
Cooperativa, JD y otros · Science Advances · 1 publicación · 25 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky
Un número relativamente pequeño de incendios forestales de rápida propagación queman áreas desproporcionadamente grandes. Pero más allá del área quemada, ¿producen los incendios rápidos consecuencias ecológicas posteriores distintivas? En este estudio, medimos las tasas diarias de crecimiento lineal del fuego y evaluamos las relaciones entre la propagación del fuego, la severidad de la quema y los indicadores de resiliencia del paisaje posterior al incendio, a partir de 3499 incendios ocurridos entre 2012 y 2023 en bosques de coníferas de Canadá y el oeste de Estados Unidos.
Discutido en Bluesky por @grumpyunclesean.bsky.social.
6. El ORF2 del virus Botrytis X suprime el silenciamiento de ARN de manera restringida por desencadenantes y está asociado con una expresión génica similar a Dicer alterada en Botrytis cinerea
Lalany, F. y otros · bioRxiv · 1 publicación · 15 me gusta · 9 republicaciones en Bluesky
La interferencia de ARN (ARNi) es un mecanismo de defensa antiviral fundamental en los hongos, pero relativamente pocos supresores de silenciamiento de ARN (VSR) micovirales han sido caracterizados funcionalmente, especialmente en huéspedes fitopatógenos. El virus Botrytis X (BVX), un virus de ARN de sentido positivo de la familia Alphaflexiviridae, infecta a Botrytis cinerea y codifica cinco marcos de lectura abiertos (ORF) predichos, la mayoría de los cuales tienen funciones desconocidas. En este estudio, analizamos los ORF 2 a 5 del BVX para detectar actividad supresora del silenciamiento de ARN mediante ensayos complementarios basados en GFP en Nicotiana benthamiana y examinamos el principal candidato en el huésped fúngico B. cinerea.
Peter Moffett @moffettpeter.bsky.social · en Bluesky
Nuevo preimpreso del laboratorio, en el que identificamos un supresor del silenciamiento de ARN de un micovirus, que también funciona en plantas.
www.biorxiv.org/content/10.6...
7. Palette: un sistema para visualizar los niveles de expresión de genes objetivo en orquídeas. 💰
Yang, Z. y otros · Fisiología de las plantas · 1 publicación · 15 me gusta · 9 republicaciones en Bluesky
Al mezclar dos tipos de pigmentos vegetales, como un artista que mezcla colores en una paleta para crear nuevos colores de flores utilizando múltiples métodos de transformación genética, esta investigación proporciona un sistema visible para rastrear la expresión genética en las orquídeas.
Fisiología de las plantas @plantphys.bsky.social · en Bluesky
Palette: un sistema para visualizar los niveles de expresión de genes diana en orquídeas (Zhenyu Yang, Su Ni, Qiyu Zhang, et al) doi.org/10.1093/plph... #CienciaDeLasPlantas @aspbofficial
Ver en Bluesky →8. Impacto del nitrógeno en los hongos ectomicorrícicos: del intercambio de recursos al ciclo del carbono forestal.
Cox, F. · Diario de botánica experimental · 1 publicación · 11 me gusta · 8 republicaciones en Bluesky
Se sabe que el nitrógeno inorgánico (N) influye en la composición y el funcionamiento de las comunidades de hongos ectomicorrícicos (ECM). Diversas investigaciones destacan consistentemente los rasgos fúngicos relacionados con el uso del carbono (C) como determinantes clave de la sensibilidad de los hongos a niveles elevados de N inorgánico, observándose una disminución de los hongos ECM con mayor demanda de C a lo largo de los gradientes de N inorgánico. Esta disminución se atribuye a menudo a una menor asignación de C de los árboles hospedadores a sus simbiontes fúngicos; sin embargo, los mecanismos precisos que subyacen a esta reducción aún no están claros, a pesar de los importantes esfuerzos de investigación. En este trabajo, se examinan los avances recientes en este campo, resaltando el papel de los requerimientos nutricionales de los hongos y la dinámica fuente-sumidero en la regulación del flujo de C hacia los hongos ECM.
Diario de botánica experimental @jxbotany.bsky.social · en Bluesky
🌲 OPINIÓN DE UN EXPERTO 🌲
Un análisis de los avances recientes sobre cómo el intercambio de recursos entre plantas y ectomicorrizas puede influir en las respuestas de las comunidades de hongos ectomicorrícicos a la disponibilidad de nitrógeno, junto con los efectos sobre el ciclo del carbono forestal - Filipa Cox
🔗 doi.org/10.1093/jxb/...
#CienciaDeLasPlantas 🧪
9. Los endosimbiontes bacterianos aumentan la virulencia de los hongos al alterar el rizobioma supresor de enfermedades. 💰
Zhou, X. <em>et al.</em> · Anfitrión celular y microbio · 1 publicación · 13 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky
Los mecanismos por los cuales los endosimbiontes bacterianos (bacterias que viven dentro de las células fúngicas) mejoran la aptitud y la virulencia de los patógenos fúngicos aún no se comprenden del todo. En este estudio, informamos que el patógeno causante de la marchitez por Fusarium en el tomate... Fusarium oxysporum F. sp. licopersici (FOL) presenta Achromobacter spp. endosimbiontes que mejoran la virulencia de los hongos.
Ákos T Kovács @evolvedbiofilm.bsky.social · en Bluesky
Los endosimbiontes bacterianos aumentan la virulencia de los hongos al alterar el rizobioma supresor de enfermedades.
@cp-cellhostmicrobe.bsky.social de Zhong Wei en la Universidad Agrícola de Nanjing
con @fdiniandreote.bsky.social y Alex Jousset
www.sciencedirect.com/science/arti...
10. Inmunidad atípica inducida por agua extracelular en plantas
Gaudreault-Lafleur, F. et al. · bioRxiv · 2 publicaciones · 14 me gusta · 5 republicaciones en Bluesky
Un mecanismo de virulencia clave y observable, empleado por numerosos patógenos microbianos para causar enfermedades, consiste en inducir un nicho rico en agua en el espacio extracelular (es decir, el apoplasto) de su huésped, conocido como lesiones empapadas de agua. Dada la ubicuidad de este mecanismo de virulencia, nos preguntamos si las plantas responden al agua extracelular inducida por patógenos activando programas inmunitarios.
Danve Castroverde @danvec.bsky.social · en Bluesky
Inmunidad atípica inducida por agua extracelular en plantas www.biorxiv.org/content/10.6...
Ver en Bluesky →11. Mecanismos de tolerancia a la desecación en el linaje verde y más allá
Schuster, J., VanBuren, R. · New Phytologist · 1 publicación · 15 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky
En este trabajo, sintetizamos nuestro conocimiento actual sobre los orígenes evolutivos y los mecanismos fundamentales que subyacen a la tolerancia de las plantas a la desecación, y los situamos en un contexto comparativo más amplio entre diferentes reinos.
12. Vidas en un gramo de suelo: vinculando la biología del ciclo de vida con la ecología del suelo.
van Gestel, J. · La revista ISME · 1 publicación · 14 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky
En este ensayo, reflexiono sobre los ciclos de vida microbianos presentes en los suelos. Partiendo de un solo gramo de suelo recolectado en nuestro campus, exploro los fundamentos conceptuales de la biología de los ciclos de vida, cómo estos ciclos surgen en su entorno y cómo se interrelacionan entre especies.
13. Panorama transcriptómico de un patógeno bacteriano bajo inmunidad vegetal 💰
Nobori, T. y otros · Actas de la Academia Nacional de Ciencias · 1 publicación · 20 me gusta · 4 republicaciones en Bluesky
En este estudio, establecimos dos métodos para el análisis del transcriptoma bacteriano in planta mediante secuenciación de ARN. Al analizar 27 combinaciones de mutantes de inmunidad vegetal y cepas de Pseudomonas syringae, logramos identificar firmas transcriptómicas bacterianas específicas influenciadas por la activación inmunitaria de la planta.
14. El modelado metabólico facilita el diseño de comunidades sintéticas mediante la simplificación de las comunidades microbianas naturales. 💰
Lin, X. y otros · Microbiología Ambiental · 1 publicación · 13 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky
Las comunidades microbianas naturales suelen tener composiciones complejas e interacciones metabólicas poco claras, lo que limita sus aplicaciones. Aclarar estas intrincadas interacciones dentro de las comunidades microbianas resulta un desafío para los métodos experimentales tradicionales. En este trabajo, desarrollamos un enfoque basado en simulación para diseñar comunidades sintéticas (SynComs) mediante la simplificación de comunidades microbianas complejas a través del modelado metabólico.
15. Del agua a la tierra: evolución de los repertorios de genes de ARNt en organismos fotosintéticos
Hummel, G. y otros · El diario EMBO · 1 publicación · 9 me gusta · 7 republicaciones en Bluesky
Los eucariotas fotosintéticos han experimentado transiciones evolutivas desde hábitats acuáticos a terrestres, acompañadas de cambios en la organización del genoma y la regulación génica. Sin embargo, la evolución de los repertorios de genes de ARN de transferencia (ARNt) ha recibido poca atención a pesar de su papel fundamental en la traducción. En este trabajo, revisamos cómo el contenido, la estructura y la organización genómica de los genes de ARNt se diversificaron en los linajes fotosintéticos, principalmente en los arqueoplastos, y cómo estos cambios se relacionan con las transiciones evolutivas.
16. Replantear las proteínas relacionadas con la patogénesis: de los inductores inmunitarios de las plantas a los nodos de integración de la resiliencia al estrés.
Mudher Abu-Altemen, W., Castroverde, CDM · Diario de botánica experimental · 1 publicación · 11 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky
Tradicionalmente consideradas proteínas de defensa contra infecciones por patógenos, las proteínas relacionadas con la patogénesis (PR) comprenden 19 familias diversas que incluyen enzimas relacionadas con la defensa (glucanasas, quitinasas, nucleasas, proteasas), péptidos antimicrobianos, inhibidores enzimáticos y proteínas generadoras de especies reactivas de oxígeno (ROS). Si bien su importancia durante el estrés biótico está bien documentada, han comenzado a surgir investigaciones sobre su regulación dinámica y funciones en el estrés abiótico, como la salinidad, la sequía, la exposición a metales pesados, la temperatura y las inundaciones. Mediante la síntesis de los conocimientos recientes y las lagunas de conocimiento críticas, proponemos que las proteínas PR son nodos de integración global del estrés en las plantas, que vinculan las respuestas al estrés abiótico y biótico.
17. La reprogramación dependiente del hierro de la señalización del receptor de péptidos asociados al daño coordina la inmunidad y la adaptación al estrés por fosfato.
Tsuchida, N. y col. · bioRxiv · 1 publicación · 11 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky
La adaptación de las plantas a la limitación de fosfato inorgánico (Pi) implica una extensa reprogramación metabólica y del desarrollo, denominada colectivamente respuesta a la deficiencia de fosfato (RPF). Aún se desconoce cómo las plantas equilibran la adquisición de nutrientes con la competencia inmunitaria. En este estudio, demostramos que la RPF remodela selectivamente la señalización de los receptores de reconocimiento de patrones (PRR) en Arabidopsis thaliana.
18. Técnicas y desafíos en el estudio de la diversidad fotosintética en plantas vasculares sumergidas de agua dulce.
Loew-Mendelson, E. et al. · Aplicaciones en Ciencias Vegetales · 2 publicaciones · 8 me gusta · 5 republicaciones en Bluesky
Si bien la diversidad fotosintética de las plantas acuáticas rivaliza con la de las especies terrestres, las condiciones ambientales que sustentan dicha diversidad difieren fundamentalmente. A pesar de estas diferencias ambientales, las plantas acuáticas y terrestres han desarrollado de forma convergente mecanismos de concentración de carbono (MCC). Sin embargo, la caracterización de estas vías en plantas sumergidas se ha quedado rezagada con respecto a los sistemas terrestres debido a las limitaciones metodológicas del entorno acuático. En este trabajo, revisamos y evaluamos los métodos contemporáneos para detectar MCC en plantas acuáticas.
19. Un sencillo protocolo de transformación por perforación de semillas para el mijo perla y el mijo africano.
Moin, M., Tyagi, W.Sreevarshitha, G. · AoB PLANTS · 1 publicación · 11 me gusta · 5 republicaciones en Bluesky
El mijo perla y el mijo africano presentan dificultades para la adopción de técnicas transgénicas o de edición genética debido a su resistencia inherente a los protocolos de transformación genética. Para superar estas limitaciones, el presente estudio tiene como objetivo optimizar el protocolo de transformación genética para el mijo perla y el mijo africano.
20. Un complejo receptor de superficie celular STRUBBELIG–NHL3 media la respuesta a la deficiencia de celulosa en Arabidopsis.
Boikine, R. y otros · Nature Plants · 1 publicación · 8 me gusta · 6 republicaciones en Bluesky
La remodelación de la pared celular tras la alteración de su integridad mediante la inhibición de la biosíntesis de celulosa depende de la quinasa receptora STRUBBELIG (SUB) y su proteína de unión QUIRKY (QKY). En este estudio, identificamos la proteína NHL3 (proteína 3 similar a la proteína 3 inducida por horquilla HIN1/NON-RACE SPECIFIC DISEASE RESISTANCE/HIN1) como un factor adicional implicado en la respuesta de inhibición de la biosíntesis de celulosa dependiente de SUB.
Imagen de portada: Andropogon gerardi by -Rorey- / iNaturalist CC BY