Los hongos micorrízicos son necesarios para la germinación y el establecimiento de plántulas en las orquídeas, por lo que las asociaciones pueden estar involucradas en la determinación de la hibridación entre especies. jaquemyn <em>et al.</em> muestran que en tres especies del género Orquídea (O. antropophora, O militaris y O. purpúrea) las semillas que se originan de cruces híbridos germinan fácilmente en el campo y los protocormos muestran superposición en las asociaciones de micorrizas con sus respectivos progenitores. Por lo tanto, las asociaciones parecen contribuir poco al aislamiento reproductivo en estas especies.