La heterostilia y la autoincompatibilidad suelen estar controladas por el complejo del locus S, pero el Prímula siebolodii muestra una variación continua de la posición de la antera y el estigma en algunas poblaciones. Yoshida et al. hacer un mapa genético de la especie y mostrar que los principales QTL para el estigma y la altura de las anteras se ubican con el S locus (que representa el 85% de la variación fenotípica). Hay QTL adicionales que controlan la altura de la antera y la longitud del tubo de la corola, algunos de los cuales son específicos de la forma. Los marcadores fueron efectivos para investigar las proporciones de morfología en poblaciones sin flores, lo cual es importante ya que la morfología floral es un objetivo de selección y las proporciones difieren entre las poblaciones.