Título del libro de Ben Goldacre Creo que encontrará que es un poco más complicado que eso, fácilmente podría tomarse como un lema para la botánica. Un ejemplo que he visto hoy es un artículo de opinión en Molecular Plant Pathology que analiza lo que hacen las proteínas efectoras de patógenos de plantas.

Nick Snelders y sus colegas preguntan si deberíamos mirar Proteínas efectoras de patógenos vegetales como manipuladores de microbiomas del huésped., y en el camino si deberíamos tener una visión diferente sobre qué son los efectores.

Si te preguntas qué efector es Snelders et al. decir: "Según las definiciones iniciales, más estrechas, los efectores son proteínas pequeñas ricas en cisteína que funcionan a través de la manipulación de las respuestas inmunitarias de las plantas". Lo que sucede es que un microbio quiere invadir una planta, pero no tiene mucho sentido hacerlo si se garantiza que morirá en el proceso. Entonces, lo que hace es secretar moléculas para interferir con la inmunidad de las plantas.

Si sabe más sobre patología vegetal que yo (casi todos), entonces no estará contento con esta definición. Snelders y sus coautores señalan que estas moléculas están haciendo mucho más que solo afectar la inmunidad, y que hay otros tipos de moléculas que los patógenos usan para combatir la planta. Entonces, en cambio, señalan que: "los efectores deben definirse como moléculas secretadas por microbios que contribuyen a la colonización de nichos".

No mencionan plantas en esta nueva definición, y eso no es casualidad.

Es fácil enfocarse en la interacción planta-patógeno, probablemente por eso estamos interesados ​​en el microbio en primer lugar, pero esa no es la única interacción que tiene el patógeno. Es probable que haya una gran comunidad microbiana alrededor de las raíces de una planta, y eso es una competencia por los recursos. En lugar de buscar efectores de inmunidad vegetal, Snelders et al. argumentamos que deberíamos estar buscando tres tipos de efectores. El primero es, obviamente, los efectores dirigidos a las plantas. Hay un segundo, dirigido a plantas y microbios. El ejemplo que dan es el efector Zt6 del patógeno del trigo Zymoseptoria tritici.

La categoría final que tienen son efectores que un patógeno apunta a otros microbios. Señalan que debilitar una planta eliminando parte de su soporte microbiano podría ayudar indirectamente a la colonización de la nueva planta.

Puedo ver que esta es una idea perfectamente razonable, pero también parece mucho más difícil de investigar. Significa que mirar la planta ya no es suficiente y hay mucha diversidad que abordar para examinar las interacciones microbio-microbio. Lo que hace que el documento sea más que interesante es que los autores reconocen que esto parece un problema, pero también muestran cómo podría abordarlo.

“Posteriormente, las pantallas funcionales destinadas a determinar su efecto directo sobre otros microbios deberían revelar si los candidatos efectores tienen o no capacidades potenciales de manipulación de la microbiota. Una pantalla inicial (y potencialmente pasada por alto) de rendimiento medio a alto podría ser probar primero si las proteínas candidatas se pueden expresar en sistemas de expresión recombinantes procarióticos o eucarióticos. Nuestro reciente descubrimiento del efector multifuncional Zt6 de Z. tritici inicialmente provino de nuestra incapacidad para expresar la proteína recombinante de longitud completa en Escherichia coli or pichia pastoris sistemas de expresión, potencialmente debido a la toxicidad (Kettles et al., 2017)".

Estudiar esto significa que tenemos una mejor idea de cómo los patógenos atacan a las plantas, pero Snelders y sus colegas concluyen con una idea más. Estos efectores son tóxicos para los microbios, entonces, ¿cómo sobreviven los patógenos, que son microbios en sí mismos? Si puede comprender la bioquímica en torno a eso, entonces puede comenzar a hacer avances novedosos en el control de patógenos.

Los dos documentos a continuación son de acceso abierto, por lo que vale la pena visitarlos si lo tuyo son los patógenos. El documento MPP es demasiado nuevo para que funcione el DOI, así que una vez que esté activo, actualizaré la publicación y eliminaré esta oración. Mientras tanto, hay un enlace directo al periódico.