El género Allium L., uno de los géneros monocotiledóneos más grandes y que incluye muchos cultivos económicamente importantes con valor nutricional y medicinal, ha sido el centro de estudios de clasificación o filogenia durante siglos. Estudios recientes sugirieron que el género se puede dividir en 15 subgéneros y 72 secciones, que se clasificaron además en tres linajes evolutivos. Sin embargo, las relaciones filogenéticas reconstruidas por uno o dos loci mostraron un soporte más débil, especialmente para el tercer linaje evolutivo, que podría no mostrar las relaciones entre especies con mucha claridad y podría dificultar un mayor estudio adaptativo y evolutivo.
Deng-Feng Xie y colegas recolectaron un total de 39 genomas completos de cloroplastos de Allium (cubriendo 12 Allium subgéneros), y combinándolos con 125 especies de plastomas de otras 19 familias de monocotiledóneas, reconstruimos la filogenia del género Allium, estimó el origen y el tiempo de divergencia de los tres linajes evolutivos e investigó la evolución adaptativa en este género y familias relacionadas.
Sus resultados detectaron una relación filogenética bien sustentada de Allium. Los PSG y los PSG con valores altos de Ka/Ks, así como morfologías diversificadas, características cromosómicas complicadas y modos reproductivos únicos pueden jugar papeles importantes en la adaptación y evolución de Allium especies. Este es el primer estudio que realizó análisis filogenéticos y evolutivos sobre el género Allium combinado con el plastoma y datos morfológicos y citológicos. El equipo espera que este estudio pueda contribuir a un mayor análisis de Allium para otros investigadores.
