Evaluaciones de la filogenia de la clase de algas verdes Chlorophyceae utilizando marcadores únicos estándar, como 18S rRNA y rbcL, generalmente no han podido igualar los árboles robustos producidos a partir de análisis de datos genómicos de cloroplastos. buchheim et al. estudie los órdenes Chaetophorales, Oedogoniales y Chaetopeltidales y demuestre que el análisis de estructura de secuencia de ITS2 produce resultados que son en gran medida congruentes con los de los datos genómicos. Por lo tanto, la técnica proporciona un complemento económico o una alternativa a los enfoques de marcador único utilizados en la filogenia de las algas verdes.