Trabajos recientes sobre el alga verde Haematococcus lacustris descubrió el genoma de plástidos más grande registrado: la friolera de 1.35 Mb (con >90 % de ADN no codificante). En una revisión reciente publicada en AoBP, David R. Smith observa más de cerca este gigantesco plastoma y lo compara con otros ADN de orgánulos grandes. David se encontró por primera vez con el H. lacustris genoma del cloroplasto mientras escaneaba la cohorte más nueva de plastomas y, para su consternación, descubrió que había sido escrito en una revista no revisada por pares que publica rápidamente informes breves sobre nuevas secuencias de cromosomas microbianos. Decidió que el H. lacustris plastoma merecía ser notado y apreciado adecuadamente por aquellos en la comunidad de investigación de cloroplastos, y nació una revisión.

Algas con grandes plastomas
Algas eucariotas con plastomas gigantes. En el sentido de las agujas del reloj desde la izquierda: cepa CCMP 3127 de Haematococcus lacustris, que es equivalente a UTEX 2505, la cepa utilizada para la secuenciación de plastomas (crédito de la imagen: Centro Nacional de Algas Marinas y Microbiota); el alga roja unicelular rodelofícea Corynoplastis japonica (crédito de la imagen: Sergio Muñoz-Gómez); y el ulvofito marino unicelular Acetabularia sp. (crédito de la imagen: Albert Kok).

En su una estrategia SEO para aparecer en las búsquedas de Google., David muestra que el H. lacustris El repertorio de codificación de plástidos no es tan inusual como se pensó inicialmente, ya que representa un conjunto estándar de rRNA, tRNA y genes codificadores de proteínas. Los espaciadores intergénicos son densos con repeticiones, y es dentro de estas regiones donde se encuentran las respuestas potenciales a la fuente de una expansión genómica tan extrema. Al comparar dos cepas estrechamente relacionadas de H. lacustris, David argumenta que la tasa de mutación del ADN del plastidio no codificante es alta y contribuye a la inflación del plastoma. Con la creciente importancia de H. lacustris Como alga industrial, es probable que lleguen muchos datos de secuenciación a GenBank en los próximos meses y años: música para los oídos de David, ya que esta unicélula con su gigantesco plastoma seguramente tiene mucho más que enseñarnos sobre la evolución del genoma de los orgánulos.

Lo más destacado del investigador

David Smith

David completó su licenciatura en la Universidad de Acadia en la hermosa Wolfville, Nueva Escocia, Canadá en 2005, y luego se mudó 75 km por la carretera a Halifax para obtener un doctorado en Genética en la Universidad de Dalhousie (2005-2010), explorando los genomas extraños y torcidos de verde algas. Cansado del Océano Atlántico, viajó por todo el país hasta Vancouver para realizar un posdoctorado en el Centro de Investigación de Biodiversidad de la Universidad de Columbia Británica (2011–2013), y continuó estudiando la evolución del genoma en las algas. Comenzó una cátedra asistente en el Departamento de Biología de la Universidad de Western Ontario en 2013 y fue ascendido a Profesor Asociado en 2018. Su grupo dedica demasiado tiempo a reflexionar sobre los orígenes de las algas no fotosintéticas (agotamiento evolutivo). También hacen mucho trabajo de redacción científica y comunicación científica. Puede encontrarlos en línea en http://www.arrogantgenome.com. Fuera del laboratorio, a David le gusta correr maratones y beber vino, pero rara vez al mismo tiempo.