Los mapas de ligamiento genético siguen siendo herramientas muy importantes para el descubrimiento de genes en muchas especies de plantas. Si bien existen varios mapas genéticos para el ryegrass perenne, ha sido difícil integrar los datos entre los estudios debido a la falta de una secuencia genómica de referencia y marcadores genéticos comunes.

Ejemplos de genotipos gráficos de los cromosomas 2 y 3 (A) antes y (B) después de la corrección del error de genotipo.
Ejemplos de genotipos gráficos de los cromosomas 2 y 3 (A) antes y (B) después de la corrección de errores genotípicos. El eje x muestra las llamadas genotípicas de los individuos y el eje y, los marcadores ordenados según su posición en el mapa cromosómico. El color azul representa el alelo del abuelo paterno, el rosa el del abuelo materno y el amarillo el estado heterocigoto. Imagen de Velmurugan et al. (2016).

Velmurugan et al. han desarrollado un mapa genético denso basado en SNP de una población de mapeo de referencia de ryegrass utilizando genotipado por secuenciación. Todos los marcadores en el mapa genético están anclados a una secuencia preliminar del genoma de uno de los abuelos de la población F2; por lo tanto, los futuros estudios genéticos que utilicen la población serán comparables.