colza (Brassica napus) es uno de los cultivos oleaginosos más importantes a nivel mundial. La deficiencia de fósforo (P) reduce severamente la altura de la planta y el número de ramas de Brassica napus. Sin embargo, las bases genéticas que controlan la altura de las plantas y el número de ramas en B. napus bajo deficiencia de P siguen siendo en gran parte desconocidos. Liu et al. destinado a extraer genes candidatos para la altura de la planta y el número de ramas mediante el estudio de asociación de todo el genoma (GWAS) y determinar los haplotipos de baja tolerancia a P.

Colza oleaginosa. Imagen: Canva.

Un panel de asociaciones de B. napus se cultivó en el campo con un suministro bajo de P (P, 0 kg ha-1) y un aporte suficiente de P (P, 40 kg ha-1) a lo largo de 2 años y se investigó la altura de la planta y el número de ramas. Se usaron más de cinco millones de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) para realizar GWAS de la altura de la planta y el número de ramas en dos suministros de P contrastantes.

Un total de 2127 SNP estaban fuertemente asociados (P < 6·25 × 10-07) con altura de planta y número de sucursal en dos suministros P. Hubo una correlación significativa entre la variación fenotípica y el número de alelos favorables de los loci asociados en los cromosomas A10 (chrA10_821671) y C08 (chrC08_27999846), lo que contribuirá a la mejora de la reproducción mediante la agregación de estos SNP. BnaA10g09290D y BnaC08g26640D se identificaron asociados con chrA10_821671 y chrC08_27999846, respectivamente. El análisis de asociación de genes candidatos y el análisis de haplotipos mostraron que las líneas endogámicas que portaban ATT en BnaA10g09290Hap1 y AAT en BnaC08g26640Hap1 tenían mayor altura de planta que las líneas que portaban otros alelos haplotípicos con bajo suministro de P.

Estos loci SNP significativos, alelos y haplotipos favorables, y las accesiones que portan estos alelos y haplotipos deseados serán útiles para el mejoramiento de tolerancia baja a P. B. napus cultivares.

ARTÍCULO DE INVESTIGACIÓN

Liu, H., Wang, J., Zhang, B., Yang, X., Hammond, JP, Ding, G., Wang, S., Cai, H., Wang, C., Xu, F., Shi , L., 2021. El estudio de asociación de todo el genoma analiza el control genético de la altura de la planta y el número de ramas en respuesta al estrés por bajo contenido de fósforo en Brassica napus. Annals of Botany. https://doi.org/10.1093/aob/mcab115

traducción al español por Lorena Marchante