El rap o canola (Brassica napus) es uno de los cultivos oleaginosos más importantes del mundo. La deficiencia de fósforo (P) disminuyendo severamente la altura de la planta y el número de ramas. Sin embargo, las bases genéticas que controlan la altura y el número de ramas en B. napus en condición de deficiencias de fósforos siguen siendo desconocidas. Liu y colaboradores se propusieron buscar genes candidatos para la altura y el número de ramas mediante un estudio de asociación del genoma (por sus siglas en inglés GWAS, estudio de asociación de todo el genoma) y determinar haplotipos tolerantes a condiciones reducidas de fósforo.

Canola. Imagen: Canva.

Un panel de asociación de B. napus fue cultivado en campo con un suministro bajo de fósforo (P, 0 kg ha-1) y con un suministro suficiente (P, 40 kg ha-1). Durante 2 años se aumentó la altura de las plantas y el número de ramas. Se utilizaron más de 5 millones de polimorfismos de un solo nucleótido (SPN) para realizar GWAS de la altura y número de ramas a dos condiciones contrastantes de fósforo.

Un total de 2127 SNP tuvieron una gran asociación (P < 6·25 × 10-07) con la altura y el número de ramas a las dos condiciones de fósforo. Hubo una medición significativa entre la variación fenotípica y el número de alelos favorables de los loci asociados a los cromosomas A10 (chrA10 821671) y C08 (chrC08 27999846), lo cual contribuirá al mejoramiento mediante la agregación de estos SNPs. Los genes candidatos BnaA10g0929OD y BnaC08g26640D están asociados a los loci chrA10 821671 y chrC08 27999846 respectivamente. Los análisis de genes candidatos y de haplotipos mostraron que las líneas endogámicas portadoras de ATT en BnaA10g0929OHap1 y AAT es BnaC08g26640Hap1 tienen una mayor altura en condiciones con bajo fósforo que las líneas portadoras de otros alelos.

Estos loci de SNPs significativos, los alelos y haplotipos favorables y las accesiones que portan estos alelos y haplotipos serán útiles para el mejoramiento y obtención de cultivares de B. napus tolerantes a condiciones de fósforos bajos.

ARTÍCULO DE INVESTIGACIÓN

Liu, H., Wang, J., Zhang, B., Yang, X., Hammond, JP, Ding, G., Wang, S., Cai, H., Wang, C., Xu, F., Shi , L., 2021. El estudio de asociación de todo el genoma analiza el control genético de la altura de la planta y el número de ramas en respuesta al estrés por bajo contenido de fósforo en Brassica napus. Annals of Botany. https://doi.org/10.1093/aob/mcab115

Traducción al español por Lorena Marchante