Los modelos de plantas funcionales y estructurales siempre tienen incertidumbre relacionada con la selección de los componentes del modelo, con el número de salidas simuladas y con la calidad de los datos utilizados en la evaluación. ford y kennedy aplicar un método de evaluación de criterios múltiples a las variables en un FSPM para la reiteración del follaje en ramas maduras, y concluir que dichos modelos deben evaluarse por su capacidad para simular criterios múltiples simultáneamente. Cuando diferentes combinaciones de valores de parámetros logran diferentes grupos de criterios de evaluación, efectivamente se puede calcular y utilizar una Frontera de Pareto para definir las fuentes de incertidumbre del modelo.