La función AoBP Premios ECOS Celebre a los investigadores que han dedicado esfuerzos considerables a promover los objetivos e ideales de la ciencia abierta. Hoy nos centramos en los logros de larry york (Noble Research Institute), uno de los tres ganadores de los Premios ECOS 2020. Larry impresionó al panel de jueces como un verdadero defensor de la ciencia abierta con un historial ejemplar que incluye publicaciones de acceso abierto, paquetes de software de código abierto y conjuntos de datos disponibles abiertamente. A continuación, puede leer sobre el trabajo de Larry y cómo cree que su premio ECOS ayudará a incentivar la ciencia abierta en su institución.
Pasión por compartir conocimientos.
A través de la enseñanza y la investigación abierta, Larry desarrolló un amor por compartir conocimientos con los demás. Parte de su compromiso con la ciencia abierta está impulsado por una creencia ética de que el conocimiento empodera y debe ser gratuito para todos para el mejoramiento personal y el beneficio de la sociedad. A Larry le apasiona compartir conocimientos, especialmente sobre raíces, tanto en su propia institución como con la comunidad en general. Es muy activo en Twitter (@LarryMattYork y @RootPhenomics) y ejecuta el @RootBiologyNoticias cuenta para permitir un fácil acceso a la información sobre las raíces de las plantas.
Predicar con el ejemplo
Larry espera que AoBP El premio ECOS ayudará a popularizar las prácticas de ciencia abierta en su institución de origen e inspirará a otros investigadores de plantas a hacer lo que puedan para compartir manuscritos, datos, códigos estadísticos y software. Liderando con el ejemplo desde que tomó el timón del laboratorio de fenómica de raíces en el Instituto de Investigación Noble, todas las publicaciones de su laboratorio se publicaron en acceso abierto, los datos se pusieron a disposición en línea y se lanzaron dos paquetes de software de código abierto en GitHub y Zenodo. También abogó por adoptar prácticas de ciencia abierta en su institución y coescribió un marco para facilitar esto como parte de su servicio en el Comité de Gestión de Datos. Larry también ha organizado y coorganizado varios talleres centrados en el fenotipado de raíces, como uno organizado con IPPN en Noble en 2019, y un próximo taller en línea coorganizado con la Dra. Lindsay Triplett y el Sociedad Americana de Fitopatología.
Fenómica raíz de código abierto
Larry está muy entusiasmado con el último proyecto de ciencia abierta que salió del laboratorio de fenómica raíz. RhizoVision Explorer (arriba) es un paquete de software nuevo, gratuito y de código abierto desarrollado por biólogos de raíces para cualquier persona que desee incluir mediciones de raíces en su trabajo (lanzamiento público previsto para finales de septiembre de 2020). Los planes de hardware para su laboratorio. Corona RhizoVision plataforma de fenotipado también están ampliamente documentados y se han compartido en línea. El laboratorio ha publicado una preimpresión sobre fenotipado de la absorción de nutrientes tasas por raíces, y actualmente está trabajando en un manuscrito que se centra en la respiración de la raíz. Se planean plataformas futuras para imágenes de campo y laboratorio (como el carro de imágenes que se muestra a continuación).
Enlaces útiles al trabajo de Larry
Perfil de Google Scholar de Larry
Sitio web del laboratorio de fenómica raíz del Instituto Noble
Laboratorio de fenómica de raíces Twitter
perfil del investigador
Larry creció en el sureste de Kentucky, enclavado en el Bosque Nacional Daniel Boone, y completó su licenciatura en biología en la Universidad de Kentucky en 2006. Hacia el final de su programa de pregrado, se interesó en un problema de modelado ecológico que involucra interacciones de raíces y ha apasionado por la biología de las raíces desde entonces. Completó su doctorado en ecología de la Universidad Estatal de Pensilvania en 2014. Su investigación de tesis se centró en las interacciones de la arquitectura del sistema radicular del maíz, la fisiología y el entorno para la absorción de nitrógeno. Completó posiciones posdoctorales en la Universidad de Nottingham y la Universidad de Missouri antes de unirse a la facultad del Instituto de Investigación Noble, una organización de investigación agrícola sin fines de lucro, en 2017. Allí, estableció el laboratorio de fenómica raíz donde el trabajo actual se enfoca en la investigación integral. arquitectura y fisiología de las plantas con el empleo activo de los tubería de fenómica funcional, especialmente con respecto a la optimización de los presupuestos de carbono de la raíz y la capacidad de absorción. Los planes futuros incluyen estudiar más sobre los roles que juegan las raíces en la salud del suelo, e incluso transferir el software desarrollado para el fenotipado de plantas al fenotipado de suelos.
